Immunglobulin-superfamilien

familie af proteiner, der indeholder et eller flere immunglobulin-domæner eller immunglobulin-lignende domæner

Immunglobulin-superfamilien er en familie af proteiner, der indeholder et eller flere immunglobulin-domæner (eller immunglobulin-lignende domæner). Immunglobulin-superfamilien omfatter immunglobuliner og i hundredvis af andre proteiner med forskellige funktioner. Eksempler udover antistofferne er celleadhæsionsmolekyler, muskelproteiner bl.a. kæmpe muskelproteinet titin og receptortyrosinkinaser. Immunglobulin-lignende domæner kan være involveret i bindinger imellem proteiner og imellem proteiner og andre ligander.

Molekylstrukturen af NCAM med fem immunglobulin-lignende domæner

Immunglobulin-domænetRediger

Immunoglobulin-domænet er en type proteindomæne der er kompakt og stabilt. Det består af en sandwich på to β-ark bygget op af 7-9 antiparallelle β-kæder, der krydser mellem de to β-ark. Typisk består domænet af 70-125 aminosyrer med en molekylvægt på 12-15 kDa.

De 7-9 β-kæders forskellige overkrydsning mellem to β-ark giver basis for fire forskellige immunglobulin-domæner: V-type, C1-type, C2-type og I-type.[1]

Fire underfamilierRediger

Der skelnes mellem fire underfamilier:

  • V-sættet (efter Variabel, V-set) med V-type immunglobulindomæne,
  • C1-sættet og C2-sættet (efter Constant, C1-set, C2-set) med hhv. C1-type og C2-type immunglobulindomæne samt
  • I-sættet (efter Intermediate, I-set) med I-type immunglobulindomæne.

Et givent protein kan være i flere underfamilier, da det kan være opbygget med flere typer immunglobulin-domæner (se eksempler).

Nogle proteiner i immunglobulin-superfamilienRediger

 
Immunglobulin-domæner i muskelproteinet titin. a) Skematisk tegning af en del af en sarkomer. b) Udsnit af I-båndet med seks immunglobulin-domæner. c) β-kæderne i to β-ark i et immunglobulin-domæne.[2]
 
Proteindomæner af A-båndet af titin. Røde bånd er immunglobulin-domæner, hvide og gule bånd er Fn3-domæner, det sorte bånd er et domæne af proteinkinase.[3]

For lister over proteiner i immunglobulin-superfamilien, se V-set, C1-set, C2-set og I-set.

HenvisningerRediger