Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages
database for SARS-CoV-2 lineages
Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (PANGOLIN eller PANGO Lineages) er et softwareprogram udviklet af medlemmer af COG-UK konsortiet.[1][2]
 | |
| Udgivet | 30. april 2020 |
|---|---|
| Skrevet i | Python |
| Licens | GNU General Public License v3.0 |
| Hjemmeside |
Pangolin.cog-uk.io Github : github.com/cov-lineages/pangolin |
Programmet giver en bruger mulighed for at tildele en SARS-CoV-2-virusprøve til en eksperimentel stamme ved at sammenligne genomet af testprøven med andre gensekvenser.[3]
Referencer redigér
- ^ Home - COG-UK Consortium: (https://www.cogconsortium.uk/ www.cogconsortium.uk 2021-01-31
- ^ Real-Time Epidemiology for COVID-19 , Centre for Genomic Pathogen Surveillance www.pathogensurveillance.net, 2021-01-31 − Software : "... used to assign lineages to SARS-CoV-2 sequences. ..." (tildele linjer/afstamning til SARS-CoV-2-sekvenser / sammenholde 'lineages' med SARS-CoV-2-sekvenser
- ^ Pangolin web application release Virological 2020-05-13, læst 2021-01-31, engelsk
Se også redigér
Eksterne henvisninger redigér
- PANGOLIN open source software at GitHub.com − Version v2.3.8
- Pangolin COVID-19 Lineage Assigner − Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak LINeages − Fra pangolin.cog-uk.io
- Om 'lineage' (genetik) : Lineage (genetic) (engelsk)
- Om 'lineage' (snarere socialantropologisk) : "Slægtskab" fra Lex.dk har om 'lineage' : "...nedstamningsgruppe (eng. lineage) er en gruppe individer, der nedstammer fra en fælles ane. ..."