Agger blev [[student]] fra [[Vestjysk Gymnasium]] i [[1983]]<ref>[http://www.ug.dk/sitecore/content/eksterntredigeredeomraader/studievalgmidtvestjylland/forside_midtogvestjylland/for%20elever%20i%20gymnasiale%20uddannelser/interviewandersagger.aspx Interview med Anders Agger]</ref> og senere uddannet journalist via Ringkøbing Amts Dagblad. Han har været ansat ved [[DR]] siden [[1989]].
Efter flere år på [[DR Nyheder]] debutererdebuterede han med dokumentaren "Heavy Agger - 14 år senere ..."., Ensom var en opfølger til Lars Oxfeldt Mortensens originale film "Heavy Agger" fra 1985. Et indblik i et særpræget heavy-rock-miljø i [[Agger|en lille vestjysk by]], der bærer hans eget navn. Personerne i dokumentaren besøger han igen i Heavy Agger III (2014).
Med 8 års mellemrum har han portrætteret elever fra [[Herlufsholm Kostskole]] (2005 og 2013). Han har udviklet og produceret serierne "Tro, håb og Ikea" (2009), "Kongehuset" (2010) og "Sømanden og& juristen (2011)Juristen - fortællinger fra et [[hospice]]" (2011)<ref>{{Cite web|url=https://www.dr.dk/presse/soemanden-juristen-historier-fra-et-hospice|title=Sømanden & Juristen - historier fra et hospice {{!}} Presse {{!}} DR|date=14. april 2011|website=DR|access-date=2021-04-23}}</ref>. Sidstnævnte var et resultat af hans seks ugers ophold på [[Anker Fjord Hospice]] som frivillig og hans møde med nogle af hospicets patienter på deres vej til døden.<ref>[https://www.dr.dk/presse/soemanden-juristen-historier-fra-et-hospice Sømanden & Juristen - historier fra et hospice. Pressemeddelelse på dr.dk 14. april 2011.]</ref>
I 2013 førte Anders Agger os igennem 8 særprægede miljøer i dokumentar-serien Indefra - med Anders Agger. Indefra fortsætter med støt stigende seertal på DR2 frem til 2019.
Desuden har Agger lavet en række lette sommerprogrammer med tv-kokken [[Anne Hjernøe]], hvor de besøger danske slotte, øer og badehoteller. I 2013 dragerdrog de sammen ud i ferielandet og rejserrejste kyststrækningerne rundt. I 2015 var de i [[Bosnien]], hvor de fulgte en ung mand, der, efter at have boet som flygtning i Danmark, vendte tilbage til sin hjemby, [[Sarajevo]], for at gense sin familie og blive gift med sin dansk-iranske kæreste.
Før [[Præsidentvalgetpræsidentvalget i [[USA]] i 2016 besøgte han sammen med Hjernøe fire danske familier, bosat i delstaterne [[Arizona]], [[Michigan]], [[Montana]] og [[South Carolina]].<ref>[https://www.dr.dk/om-dr/programmer-og-koncerter/anne-og-anders-i-mangfoldighedens-usa ''Anne og Anders i mangfoldighedens USA''],''DR Dokumentar 30. juni 2016''</ref> I 2018 rejste makkerparret igennem Storbritannien for at belyse efterveerne af [[Brexit]]. Og iI 2019 beskrev de Mellemøsten via landene Oman, Jordan, Libanon og Israel.; Detdet blev sommerens mest sete program-serieprogramserie på DR1.<ref>[https://www.dr.dk/om-dr/nyheder/ugens-tv-top-10-539000-tog-med-anne-og-anders-til-mellemoesten 539.000 tog med Anne og Anders til Mellemøsten] på .dr.dk 31. juli 2019</ref>
