Standardaminosyre: Forskelle mellem versioner
Content deleted Content added
Danielle (diskussion | bidrag) typoer og småret |
MGA73bot (diskussion | bidrag) m Retter engelsk kategori; kosmetiske ændringer |
||
Linje 5:
<gallery>
image:L-alanine-skeletal.png|[[Alanin|<small>L</small>-Alanin]]<br />(Ala / A)
image:L-arginine-skeletal-(tall).png|[[Arginin|<small>L</small>-Arginin]]<br />(Arg / R)
image:L-asparagine-skeletal.png|[[Asparagin|<small>L</small>-Asparagin]]<br />(Asn / N)
image:L-aspartic-acid-skeletal.png|[[Asparaginsyre|<small>L</small>-Asparaginsyre]]<br />(Asp / D)
image:L-cysteine-skeletal.png|[[Cystein|<small>L</small>-Cystein]]<br />(Cys / C)
image:L-glutamic-acid-skeletal.png|[[Glutaminsyre|<small>L</small>-Glutaminsyre]]<br />(Glu / E)
image:L-glutamine-skeletal.png|[[Glutamin|<small>L</small>-Glutamin]]<br />(Gln / Q)
image:Glycine-skeletal.png|[[Glycin]]<br />(Gly / G)
image:L-histidine-skeletal.png|[[Histidin|<small>L</small>-Histidin]]<br />(His / H)
image:L-isoleucine-skeletal.png|[[Isoleucin|<small>L</small>-Isoleucin]]<br />(Ile / I)
image:L-leucine-skeletal.png|[[Leucin|<small>L</small>-Leucin]]<br />(Leu / L)
image:L-lysine-skeletal.png|[[Lysin|<small>L</small>-Lysin]]<br />(Lys / K)
image:L-methionine-skeletal.png|[[Methionin|<small>L</small>-Methionin]]<br />(Met / M)
image:L-phenylalanine-skeletal.png|[[Phenylalanin|<small>L</small>-Fenylalanin]]<br />(Phe / F)
image:L-proline-skeletal.png|[[Prolin|<small>L</small>-Prolin]]<br />(Pro / P)
image:L-serine-skeletal.png|[[Serin|<small>L</small>-Serin]]<br />(Ser / S)
image:L-threonine-skeletal.png|[[Threonin|<small>L</small>-Threonin]]<br />(Thr / T)
image:L-tryptophan-skeletal.png|[[Tryptophan|<small>L</small>-Tryptophan]]<br />(Trp / W)
image:L-tyrosine-skeletal.png|[[Tyrosin|<small>L</small>-Tyrosin]]<br />(Tyr / Y)
image:L-valine-skeletal.png|[[Valin|<small>L</small>-Valin]]<br />(Val / V)
</gallery>
== Kemiske egenskaber ==
Det følgende er en tabel, der lister et- og tre-bogstavsforkortelser samt kemiske egenskaber for standardaminosyrernes sidekæder. De listede masser er baseret på vægtgennemsnit for de enkelte elementers [[isotop]]er, som de er [[naturlig forekomst|naturligt forekomne]]. Bemærk at ved dannelsen af en [[peptidbinding]] elimineres et [[vand]]molekyle, således at en aminosyres masse i en proteinkæde reduceres med 18,01524 Da. Et-bogstavsforkortelsen for en ubestemt aminosyre er ''X''. Trebogstavsforkortelsen ''Asx'' og et-bogstavsforkortelsen ''B'' betyder, at den omtalte aminosyre er enten [[asparagin]] eller [[asparaginsyre]]; ''Glx'' og ''Z'' betyder enten [[glutaminsyre]] eller [[glutamin]]; og ''Xle'' og ''J'' betyder enten [[leucin]] eller [[isoleucin]]. [[IUPAC nomenklatur|IUPAC]]/[[International Union of Biochemistry and Molecular Biology|IUBMB]] anbefaler nu også at ''Sec'' og ''U'' refererer til [[selenocystein]], mens ''Pyl'' og ''O'' refererer til [[pyrrolysin]].
=== Generelle kemiske egenskaber ===
{| class="wikitable sortable" style="text-align: center"
|-
Linje 38:
! Gennemsnitsmasse ([[Dalton (kemisk enhed)|Da]])
! [[Isoelektrisk punkt|pI]]
! [[Dissociationskonstant|pK]]<sub>1</sub><br />(α-COOH)
! pK<sub>2</sub><br />(α-<sup>+</sup>NH<sub>3</sub>)
|-
! [[Alanin]]
Linje 210:
|}
=== Sidekædeegenskaber ===
{| class="wikitable sortable"
Linje 218:
! Abbreviation
! Sidekæde
! [[Hydrofobisk|Hydro-<br />fobisk]]
! pKa
! [[Kemisk polaritet|Polær]]
Linje 224:
! Lille
! Meget lille
! [[Aromatisk forbindelse|Aromatisk]]<br />eller [[alifatisk forbindelse|alifatisk]]
! [[Van der Waals radius|van der Waals<br />volumen]]
|-
! [[Alanin]]
Linje 503:
Note: pKa-værdier for en aminosyre er typisk en anelse forskellige, når den befinder sig i forskellige miljøer for eksempel på overfladen og inde i et protein. [[Protein-pKa-beregning]] bruges nogle gange til at beregne ændringen i pKa-værdien i en sådan situation.
=== Genudtrykkelse og biokemi ===
{| class="wikitable sortable"
|- align="center"
Linje 510:
! Abbreviation
! [[genetisk kode|Kode(r)]]
! Forekomst<br />i proteiner<br />(%)
! Essentiel[[#essentialnote|***]] i mennesker
|-
Linje 671:
<span id="essentialnote">***</span> Mennesker kan ikke syntetisere en [[essentiel aminosyre]] og disse må derfor suppleres gennem diæt. Betingede essentielle aminosyrer er ikke normalt nødvendige at få tilført gennem diæt, men må dog suppleres i specifikke populationer, der ikke syntetiserer dem i tilstrækkelig mængde.
=== Bemærkninger ===
{| class="wikitable"
Linje 757:
| S
| Ser
| Serin og threonin har en kort gruppe, som ender med en [[hydroxyl]]gruppe. Pga. det meget [[elektronegativitet|
|-
! [[Threonin]]
Linje 780:
|}
== Referencer ==
*{{cite book |last=Nelson |first=David L. |coauthors=Cox, Michael M. |title=Lehninger Principles of Biochemistry |edition=3rd ed |year=2000 |publisher=Worth Publishers |isbn=1-57259-153-6 }}
*{{cite journal | last=Kyte | first=J. | coauthors=Doolittle, R. F. | year=1982 | title=A simple method for displaying the hydropathic character of a protein | journal=[[J. Mol. Biol.]] | volume=157 | issue=1 | pages=105-132 | id=PMID 7108955 }}
[[
[[Kategori:Nitrogenmetabolisme]]
[[
[[ar:قائمة الأحماض الأمينية]]
| |||