Forskel mellem versioner af "Standardaminosyre"

67 bytes tilføjet ,  for 11 år siden
m
Retter engelsk kategori; kosmetiske ændringer
(typoer og småret)
m (Retter engelsk kategori; kosmetiske ændringer)
 
<gallery>
image:L-alanine-skeletal.png|[[Alanin|<small>L</small>-Alanin]]<br />(Ala&nbsp;/&nbsp;A)
image:L-arginine-skeletal-(tall).png|[[Arginin|<small>L</small>-Arginin]]<br />(Arg&nbsp;/&nbsp;R)
image:L-asparagine-skeletal.png|[[Asparagin|<small>L</small>-Asparagin]]<br />(Asn&nbsp;/&nbsp;N)
image:L-aspartic-acid-skeletal.png|[[Asparaginsyre|<small>L</small>-Asparaginsyre]]<br />(Asp&nbsp;/&nbsp;D)
image:L-cysteine-skeletal.png|[[Cystein|<small>L</small>-Cystein]]<br />(Cys&nbsp;/&nbsp;C)
image:L-glutamic-acid-skeletal.png|[[Glutaminsyre|<small>L</small>-Glutaminsyre]]<br />(Glu&nbsp;/&nbsp;E)
image:L-glutamine-skeletal.png|[[Glutamin|<small>L</small>-Glutamin]]<br />(Gln&nbsp;/&nbsp;Q)
image:Glycine-skeletal.png|[[Glycin]]<br />(Gly&nbsp;/&nbsp;G)
image:L-histidine-skeletal.png|[[Histidin|<small>L</small>-Histidin]]<br />(His&nbsp;/&nbsp;H)
image:L-isoleucine-skeletal.png|[[Isoleucin|<small>L</small>-Isoleucin]]<br />(Ile&nbsp;/&nbsp;I)
image:L-leucine-skeletal.png|[[Leucin|<small>L</small>-Leucin]]<br />(Leu&nbsp;/&nbsp;L)
image:L-lysine-skeletal.png|[[Lysin|<small>L</small>-Lysin]]<br />(Lys&nbsp;/&nbsp;K)
image:L-methionine-skeletal.png|[[Methionin|<small>L</small>-Methionin]]<br />(Met&nbsp;/&nbsp;M)
image:L-phenylalanine-skeletal.png|[[Phenylalanin|<small>L</small>-Fenylalanin]]<br />(Phe&nbsp;/&nbsp;F)
image:L-proline-skeletal.png|[[Prolin|<small>L</small>-Prolin]]<br />(Pro&nbsp;/&nbsp;P)
image:L-serine-skeletal.png|[[Serin|<small>L</small>-Serin]]<br />(Ser&nbsp;/&nbsp;S)
image:L-threonine-skeletal.png|[[Threonin|<small>L</small>-Threonin]]<br />(Thr&nbsp;/&nbsp;T)
image:L-tryptophan-skeletal.png|[[Tryptophan|<small>L</small>-Tryptophan]]<br />(Trp&nbsp;/&nbsp;W)
image:L-tyrosine-skeletal.png|[[Tyrosin|<small>L</small>-Tyrosin]]<br />(Tyr&nbsp;/&nbsp;Y)
image:L-valine-skeletal.png|[[Valin|<small>L</small>-Valin]]<br />(Val&nbsp;/&nbsp;V)
</gallery>
 
== Kemiske egenskaber ==
Det følgende er en tabel, der lister et- og tre-bogstavsforkortelser samt kemiske egenskaber for standardaminosyrernes sidekæder. De listede masser er baseret på vægtgennemsnit for de enkelte elementers [[isotop]]er, som de er [[naturlig forekomst|naturligt forekomne]]. Bemærk at ved dannelsen af en [[peptidbinding]] elimineres et [[vand]]molekyle, således at en aminosyres masse i en proteinkæde reduceres med 18,01524 Da. Et-bogstavsforkortelsen for en ubestemt aminosyre er ''X''. Trebogstavsforkortelsen ''Asx'' og et-bogstavsforkortelsen ''B'' betyder, at den omtalte aminosyre er enten [[asparagin]] eller [[asparaginsyre]]; ''Glx'' og ''Z'' betyder enten [[glutaminsyre]] eller [[glutamin]]; og ''Xle'' og ''J'' betyder enten [[leucin]] eller [[isoleucin]]. [[IUPAC nomenklatur|IUPAC]]/[[International Union of Biochemistry and Molecular Biology|IUBMB]] anbefaler nu også at ''Sec'' og ''U'' refererer til [[selenocystein]], mens ''Pyl'' og ''O'' refererer til [[pyrrolysin]].
 
=== Generelle kemiske egenskaber ===
{| class="wikitable sortable" style="text-align: center"
|-
! Gennemsnitsmasse ([[Dalton (kemisk enhed)|Da]])
! [[Isoelektrisk punkt|pI]]
! [[Dissociationskonstant|pK]]<sub>1</sub><br />(α-COOH)
! pK<sub>2</sub><br />(α-<sup>+</sup>NH<sub>3</sub>)
|-
! [[Alanin]]
|}
 
=== Sidekædeegenskaber ===
 
{| class="wikitable sortable"
! Abbreviation
! Sidekæde
! [[Hydrofobisk|Hydro-<br />fobisk]]
! pKa
! [[Kemisk polaritet|Polær]]
! Lille
! Meget lille
! [[Aromatisk forbindelse|Aromatisk]]<br />eller [[alifatisk forbindelse|alifatisk]]
! [[Van der Waals radius|van der Waals<br />volumen]]
|-
! [[Alanin]]
Note: pKa-værdier for en aminosyre er typisk en anelse forskellige, når den befinder sig i forskellige miljøer for eksempel på overfladen og inde i et protein. [[Protein-pKa-beregning]] bruges nogle gange til at beregne ændringen i pKa-værdien i en sådan situation.
 
=== Genudtrykkelse og biokemi ===
{| class="wikitable sortable"
|- align="center"
! Abbreviation
! [[genetisk kode|Kode(r)]]
! Forekomst<br />i proteiner<br />(%)
! Essentiel[[#essentialnote|***]] i mennesker
|-
<span id="essentialnote">***</span> Mennesker kan ikke syntetisere en [[essentiel aminosyre]] og disse må derfor suppleres gennem diæt. Betingede essentielle aminosyrer er ikke normalt nødvendige at få tilført gennem diæt, men må dog suppleres i specifikke populationer, der ikke syntetiserer dem i tilstrækkelig mængde.
 
=== Bemærkninger ===
 
{| class="wikitable"
| S
| Ser
| Serin og threonin har en kort gruppe, som ender med en [[hydroxyl]]gruppe. Pga. det meget [[elektronegativitet|elektonegativeelektonegativeiltatom]]iltatom i sidekæderne virker serin og threonin ofte som hydrogendonorer i enzymer. Begge er meget hydrofile og ydre overfladeregioner i vandopløselige proteiner er derfor ofte rige på disse to.
|-
! [[Threonin]]
|}
 
== Referencer ==
*{{cite book |last=Nelson |first=David L. |coauthors=Cox, Michael M. |title=Lehninger Principles of Biochemistry |edition=3rd ed |year=2000 |publisher=Worth Publishers |isbn=1-57259-153-6 }}
*{{cite journal | last=Kyte | first=J. | coauthors=Doolittle, R. F. | year=1982 | title=A simple method for displaying the hydropathic character of a protein | journal=[[J. Mol. Biol.]] | volume=157 | issue=1 | pages=105-132 | id=PMID 7108955 }}
 
[[CategoryKategori:Aminosyrer| ]]
[[kategori:nitrogenmetabolisme]]
[[Kategori:Nitrogenmetabolisme]]
[[CategoryKategori:Ernæring]]
 
[[ar:قائمة الأحماض الأمينية]]
235.052

redigeringer