[[2006]] blev endnu engang et godt år for Team CSC. De vandt bl.a. [[Paris-Roubaix]] ([[Fabian Cancellara]]) og [[Giro d'Italia]] (Ivan Basso). Men Dagen før Tour de France skulle skydes i gang blev Ivan Basso suspenderet fordi hans navn optrådte i den spanske dopingsag [[OperacionOperation Puerto]]. Derfor blev Team CSC's nye kaptajn [[Carlos Sastre]]. Han klarede kaptajnrollen godt og sluttede samlet nummer 4. (er senere rykket op på en 3. plads, da Floyd Landis fik frataget sejren pga. doping) Team CSC fik desuden 2 etapesejre i Touren ([[Fränk Schleck]] og [[Jens Voigt]]). I [[Post Danmark Rundt]] dominerede Team CSC igen løbet fuldstændig, hvor stjernerytteren Fabian Cancellara tog 2 etapesejre undervejs og vandt løbet samlet. Alt i alt vandt Team CSC 51 sejre i 2006. Og vandt desuden, for andet år i træk, ProTour'rens holdkonkurrence.
