FL Studio's brugerflade består af fem frit bevægelige vinduer. Fl Studio understøtter brugen af dobbelt og tredobbelt skærmopsætning.'''<nowiki> Channel '</nowiki>'' vinduet tillader brugeren at indsætte [[VST|VSTi]]'er, lydspor samt [[sampler]]s og knytte dem til et mikser spor'''''. '''''<nowiki/>''Channel' ''vinduet indeholder desuden en '''<nowiki>step sequencer'</nowiki>'' hvor man hurtigt kan skabe rytmer. '''<nowiki>Piano roll'</nowiki>'' vinduet bruger man til at komponere melodier. Det er opsat som et todimensionelt net, hvor den vertikale akse repræsenterer tonehøjde og den horisontale akse repræsenterer tid. I '''playlist'' ''vinduet kan man arrangere de mindre stykker af musik, man har sammensat i '''channel'' ''vinduet, til et samlet stykke musik. '''<nowiki>Mixer'</nowiki>'' vinduet bliver brugt til at balancere lydniveauer, tilføje forskellige effekter samt optage diverse. '''<nowiki>Browse'</nowiki>'' oversigten giver hurtig adgang til alle ens samples, plugins, presets og andre *.flp filer.
