Johan Roos, som efterfulgte Finn Junge Jensen, stod i spidsen for en meget ambitiøs strategiproces{{kilde mangler|dato=september 2015}} indtil han fratrådte den 25. marts 2011 som følge af en fejlslagen fusion mellem CBS' og Scandinavian International Management Institut, SIMI. [[Dekan]] for forskning Allan Irwin blev konstitueret som midlertidig rektor. Bestyrelsenbestyrelse besluttede i november 2011 at ansætte [[cand.silv.]] Per Holten Andersen, tidl.dekan på [[Det Biovidenskabelige Fakultet for Fødevarer, Veterinærmedicin og Naturressourcer|LIFE]], [[Københavns Universitet]], som ny rektor, og han tiltrådte den 1. februar 2012.
Følgende har beklædt rektorposten gennem tiden<ref>http://100.cbs.dk/portraits/</ref>:
