DNA: Forskelle mellem versioner

Content deleted Content added
fjerner dobbelttekst
m bot: flyt sprogikon bagrest; kosmetiske ændringer
Linje 1:
[[FileFil:DNA Structure+Key+Labelled.pn NoBB.png|thumb|right|340px|Strukturen af DNA-[[dobbelthelix]]. [[Atom]]erne i strukturen er farvekodet efter [[grundstof]], og to basepars detaljerede struktur er vist i nederste højre hjørne.]]
[[FileFil:ADN animation.gif|thumb|Strukturen i en del af en DNA-[[dobbelthelix]]]]
 
'''Deoxyribonukleinsyre''' ('''DNA''', fra det [[engelsk (sprog)|engelske]] ord '''''D'''eoxyribo'''n'''ucleic''' a'''cid'') er et [[molekyle]], som bærer på de fleste af de [[genetik|genetiske]] instruktioner, der bruges ved vækst, udvikling, funktion og [[reproduktion]] af alle kendte levende [[organisme]]r og mange [[virus (biologi)|vira]]. DNA og [[RNA]] er [[nukleinsyre]]r; sammen med [[protein]]er og [[Polysakkarid|komplekse kulhydrater]] udgør de de tre store typer [[makromolekyle]]r, der er essentielle for alle kendte former for [[liv]].
 
De fleste DNA-molekyler består af to [[biopolymer]]-strenge snoet omkring hinanden i en [[dobbelthelix]]. De to DNA-strenge er kendt som [[polynukleotid]]er, siden de består af [[monomer|simplere enheder]] kaldet [[nukleotid]]er.<ref>{{cite web|last1=Purcell|first1=Adam|title=DNA|url=http://basicbiology.net/micro/genetics/dna|website=Basic Biology}}</ref> Hvert nukleotid består af en [[nitrogenholdig base|nitrogenholdig]] [[nukleobase]] — enten [[cytosin]] (C), [[guanin]] (G), [[adenin]] (A) eller [[thymin]] (T) — såvel som en [[Monosakkarid|sukker]] kaldet [[deoxyribose]] og en [[fosfat]]gruppe. Nukleotiderne forbindes med hinanden i en kæde af [[Kovalent binding|kovalente bindinger]] mellem det ene nukleotids sukker og det andets fosfat, hvilket resulterer i en alternerende [[rygradskæde|sukker-fosfat-rygrad]].
 
DNA opbevarer biologisk [[information]]. DNA-rygraden er resistent over for spaltning, og begge strenge af den dobbelt-strengede struktur opbevarer den samme biologiske information. Biologisk information replikeres, idet de to strenge separeres. En betragtelig del af DNA (mere end 98 % for mennesker) er [[Ikke-kodende DNA|ikke-kodende]], hvilket betyder, at disse sektioner ikke fungerer som koder for proteinsekvenser.
Linje 10:
Inde i celler organiseres DNA i lange strukturer kaldet [[kromosom]]er. Under [[celledeling]] duplikeres disse kromosomer ved en proces kaldet [[DNA-replikation]], hvilket giver hver celle sit eget komplette sæt af kromosomer. [[Eukaryoter|Eukaryote organismer]] ([[dyr]], [[plante]]r, [[svampe]] og [[protister]]) opbevarer det meste af deres DNA i [[cellekerne]]n og noget af deres DNA i [[organel]]ler, såsom [[mitokondrie]]r eller [[grønkorn]].<ref>{{cite book | last = Russell | first = Peter | title = iGenetics | publisher = Benjamin Cummings | location = New York | year = 2001 | isbn = 0-8053-4553-1 }}</ref> I modsætning hertil opbevarer [[prokaryoter]] ([[bakterier]] og [[arkæer]]) kun deres DNA i [[cytoplasma]]et. Inde i kromosomerne komprimeres og organiseres DNA'en af [[kromatin]]proteiner såsom [[histon]]. Disse kompakte strukturer guider interaktionerne mellem DNA og andre proteiner, og hjælper med at kontrollere, hvilke dele af DNA'en der transskriberes. Alle levende ting har en særlig genetisk makeup , der er unik for deres art . Dyr , planter , encellede organismer , og endda nogle vira indeholder deoxyribonukleinsyre , også kaldet DNA , som indeholder disse gener. De er ansvarlige for at skabe nye celler og til at holde tegninger af organismen. I øjeblikket er genforskere studerer DNA med henblik på at forstå, hvordan man bekæmpe visse sygdomme , og også for at finde ud af at kunstigt replikere DNA strenge for at skabe celler i et laboratorium indstilling.
 
== Egenskaber ==
[[FileFil:DNA chemical structure.svg|thumb|DNA's kemiske struktur; [[hydrogenbinding]]er vist som prikkede linjer]]
 
DNA er en lang [[polymer]] lavet af gentagende enheder kaldet [[nukleotid]]er.<ref>{{cite book | last = Saenger | first = Wolfram | title = Principles of Nucleic Acid Structure | publisher = Springer-Verlag | location = New York | year = 1984 | isbn = 0-387-90762-9 }}</ref><ref name="Alberts">{{cite book |last = Alberts|first = Bruce|author2 = Johnson, Alexander|author3 = Lewis, Julian|author4 = Raff, Martin|author5 = Roberts, Keith|author6 = Walters, Peter|title = Molecular Biology of the Cell; Fourth Edition|publisher = Garland Science|year = 2002|location = New York and London|isbn = 0-8153-3218-1|oclc = 145080076 |url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21054/}}</ref> DNA's struktur er ikke-statisk,<ref>{{Cite journal|title = Structural diversity of supercoiled DNA|url = http://www.nature.com/ncomms/2015/151012/ncomms9440/full/ncomms9440.html|journal = Nature Communications|date = 2015-10-12|pmc = 4608029|pmid = 26455586|volume = 6|doi = 10.1038/ncomms9440|first = Rossitza N.|last = Irobalieva|first2 = Jonathan M.|last2 = Fogg|first3 = Daniel J.|last3 = Catanese Jr|first4 = Thana|last4 = Sutthibutpong|first5 = Muyuan|last5 = Chen|first6 = Anna K.|last6 = Barker|first7 = Steven J.|last7 = Ludtke|first8 = Sarah A.|last8 = Harris|first9 = Michael F.|last9 = Schmid|pages=8440}}</ref> alle arter består af to heliske kæder, der hver snor sig om den samme akse, og hver med en bane på 34&nbsp;[[Ångstrøm|ångström]] (3,4&nbsp;[[nanometer]]) og en radius på 10&nbsp;ångström (1,0&nbsp;nanometer).<ref name=FWPUB>{{cite journal | author = Watson JD, Crick FH | title = A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid | journal = Nature | volume = 171 | issue = 4356 | pages = 737–738 | year = 1953 | pmid = 13054692 | doi = 10.1038/171737a0 | url = http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf | format = PDF | bibcode = 1953Natur.171..737W }}</ref> Ifølge et andet studium kan DNA-kæden, i en bestemt opløsning, måles til at være 22 til 26&nbsp;ångström bred (2,2 til 2,6&nbsp;nanometer), og en nukleotidenhed blev målt til at være 3,3&nbsp;Å (0,33&nbsp;nm) lang.<ref>{{cite journal | author = Mandelkern M, Elias JG, Eden D, Crothers DM | title = The dimensions of DNA in solution | journal = J Mol Biol | volume = 152 | issue = 1 | pages = 153–61 | year = 1981 | pmid = 7338906 | doi = 10.1016/0022-2836(81)90099-1 }}</ref> Selvom hver individuel gentagende enhed er meget lille, kan DNA-polymerer være meget store molekyler indeholdende millioner af nukleotider. For eksempel består DNA'en i det største menneske[[kromosom]], [[kromosom 1 (mennesket)|kromosom nummer 1]], af omkring 220 millioner [[basepar]]<ref>{{cite journal | author = Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, Kaul R, Swarbreck D, Dunham A | title = The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 | journal = Nature | volume = 441 | issue = 7091 | pages = 315–21 | year = 2006 | pmid = 16710414 | doi = 10.1038/nature04727 | bibcode = 2006Natur.441..315G |display-authors=etal}}</ref> og ville være 85&nbsp;mm langt, hvis det blev rettet ud.
Linje 17:
I levende organismer eksisterer DNA normalt ikke som et enkelt molekyle, men derimod som et molekylepar, der holdes stramt sammen.<ref name=autogenerated2>{{cite journal | author = Watson JD, Crick FH | title = A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid | journal = Nature | volume = 171 | issue = 4356 | pages = 737–738 | year = 1953 | pmid = 13054692 | doi = 10.1038/171737a0 | url = http://www.nature.com/nature/dna50/watsoncrick.pdf | format = PDF | accessdate = 4. maj 2009 | bibcode = 1953Natur.171..737W }}</ref><ref name="berg">Berg J., Tymoczko J. and Stryer L. (2002) ''Biochemistry.'' W. H. Freeman and Company ISBN 0-7167-4955-6</ref> Disse to lange strenge flettes omkring hinanden i form af en [[dobbelthelix]]. Hver nukleotidenhed indeholder både en del af molekylets rygradssegment, som holder kæden sammen, og en nukleobase, som interagerer med den anden DNA-streng i helixen. En nukleobase, der er forbundet med en sukker, kaldes et [[nukleosid]], mens en base, der er forbundet med en sukker og en eller flere fosfatgrupper, kaldes et [[nukleotid]]. En polymer bestående af flere forbundne nukleotider (som i DNA) kaldes et [[polynukleotid]].<ref name="IUPAC">[http://www.chem.qmul.ac.uk/iupac/misc/naabb.html Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and their Constituents] IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (CBN). Retrieved 3 January 2006.</ref>
 
DNA-strengens rygrad består af alternerende [[fosfat]]- og [[kulhydrat|sukkersukkergrupper]]grupper.<ref name=Ghosh>{{cite journal | author = Ghosh A, Bansal M | title = A glossary of DNA structures from A to Z | journal = Acta Crystallogr D | volume = 59 | issue = 4 | pages = 620–6 | year = 2003 | pmid = 12657780 | doi = 10.1107/S0907444903003251 }}</ref> Sukkeret i DNA er [[deoxyribose|2-deoxyribose]], som er en [[pentose]] (fem-[[carbon]]-sukker). Sukkeret bindes sammen af fosfatgrupper, som danner [[Fosfodiester|fosfodiesterbindingerfosfodiester]]bindinger mellem det tredje og femte carbonatom på nærliggende sukkerringe. Disse asymmetriske [[kovalent binding|bindinger]] betyder, at en DNA-streng har en retning. I en dobbelthelix er retningen på nukleotiderne i en streng modsat af nukleotidernes retning i den anden streng: Strengene er ''antiparallelle''. DNA-strengenes asymmetriske ender kaldes 5′-enden og 3′-enden, hvor 5′-enden har en terminal fosfatgruppe og 3′-enden har en terminal hydroxylgruppe. En stor forskel mellem DNA og [[RNA]] er sukkeret, der i DNA er 2-deoxyribose og i RNA den alternative pentosesukker [[ribose]].<ref name=berg/>
 
[[FileFil:DNA orbit animated static thumb.png|thumb|upright|En sektion af DNA. Baserne ligger horisontalt mellem de to spiralsnoede strenge.<ref>Created from [http://www.rcsb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=1D65 PDB 1D65]</ref> ([[:File:DNA orbit animated.gif|animeret version]]).]]
 
DNA-dobbelthelixen stabiliseres primært af to kræfter: [[hydrogenbinding]]er mellem nukleotider og [[π-π-vekselvirkning|basestablingbasestablingsinteraktioner]]sinteraktioner mellem [[aromaticitet|aromatiske]] nukleobaser.<ref name="Yakovchuk2006">{{cite journal | author = Yakovchuk P, Protozanova E, Frank-Kamenetskii MD | title = Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 34 | issue = 2 | pages = 564–74 | year = 2006 | pmid = 16449200 | pmc = 1360284 | doi = 10.1093/nar/gkj454 }}</ref> I cellens vandige miljø tilpasser nukleobasernes konjugerede [[pi-binding|π-bindinger]] sig vinkelret på DNA-molekylets akse, hvilket minimerer deres interaktion med [[solvatisering]]sskallen og derfor deres [[Gibbs fri energi]]. De fire baser i DNA er [[adenin]] (forkortet A), [[cytosin]] (C), [[guanin]] (G) og [[thymin]] (T). Disse fire baser forbindes til sukkeret/fosfatet for at danne det komplette nukleotid, som vist for [[adenosinmonofosfat]]. [[Adenin]] parres med [[thymin]], mens [[guanin]] parres med [[cytosin]]. Det blev repræsenteret af A-T-basepar og G-C-basepar.<ref>Burton E. Tropp - ''"Molecular Biology"''- Jones and Barlett Learning, ISBN 978-0-7637-8663-2</ref><ref>https://www.mun.ca - ''Watson-Crick Structure of DNA - 1953''</ref>
 
=== Nukleobaseklassifikation ===
Nukleobaserne klassificeres i to typer: [[purin]]erne, A og G, som er fusionerede fem- og seksdelte [[heterocyklisk forbindelse|heterocykliske forbindelser]], og [[pyrimidin]]erne, de seksleddede ringe C og T.<ref name=berg/> En femte pyrimidinnukleobase, [[uracil]] (U), erstatter normalt thymin i RNA og adskiller sig fra thymin idet den mangler en [[methyl]]gruppe på sin ring. Udover RNA og DNA er der også blevet skabt en lang række kunstige [[nukleinsyreanalog]]er til brug ved studier i nukleinsyrernes egenskaber, eller i bioteknologi.<ref>{{cite journal | author = Verma S, Eckstein F | title = Modified oligonucleotides: synthesis and strategy for users | journal = Annu. Rev. Biochem. | volume = 67 | pages = 99–134 | year = 1998 | pmid = 9759484 | doi = 10.1146/annurev.biochem.67.1.99 }}</ref>
 
Uracil findes normalt ikke i DNA og opstår kun som et nedbrydningsprodukt af cytosin. I en række [[bakteriofag]]er&nbsp;– ''Bacillus subtilis''-bakteriofagerne PBS1 og PBS2 og ''Yersinia''-bakteriofagen piR1-37&nbsp;– er thymin erstattet af uracil.<ref name=Kiljunen2005>{{cite journal | author = Kiljunen S, Hakala K, Pinta E, Huttunen S, Pluta P, Gador A, Lönnberg H, Skurnik M | title = Yersiniophage phiR1-37 is a tailed bacteriophage having a 270 kb DNA genome with thymidine replaced by deoxyuridine | journal = Microbiology | volume = 151 | issue = 12 | pages = 4093–4102 | year = 2005 | pmid = 16339954 | doi = 10.1099/mic.0.28265-0 }}</ref> En anden fag – stafylokokkerfag S6 – er blevet identificeret som et genom, hvor thymin er erstattet af uracil.<ref name=Uchiyama2014>{{cite journal | author = Uchiyama J, Takemura-Uchiyama I, Sakaguchi Y, Gamoh K, Kato SI, Daibata M, Ujihara T, Misawa N, Matsuzaki S | date = Mar 2014 | title = Intragenus generalized transduction in ''Staphylococcus'' spp. by a novel giant phage | url = | journal = ISME J. | volume = 8| issue = | pages = 1949–1952| doi = 10.1038/ismej.2014.29 }}</ref>
 
[[Base J]] (beta-d-glukopyranosyloxymethyluracil), en modificeret form af uracil, findes også i en række organismer: flagellaterne ''[[Diplonema (protozoer)|Diplonema]]'' og ''[[Euglena]]'', og alle [[Slægt (biologi)|slægter]] af [[Kinetoplastida|kinetoplastidkinetoplastider]]er.<ref name=Simpson1998>{{cite journal | author = Simpson L | title = A base called J | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 95 | issue = 5 | pages = 2037–2038 | year = 1998 | pmid = 9482833 | pmc = 33841 | doi = 10.1073/pnas.95.5.2037 | url = | bibcode = 1998PNAS...95.2037S }}</ref> Biosyntese af J sker i to trin: i det første trin konverteres en specifik thymidin i DNA til hydroxymethyldeoxyuridin; i det andet [[Glykosylering|glykosyleres]] HOMedU til at danne form J.<ref name=Borst2008>{{cite journal | author = Borst P, Sabatini R | title = Base J: discovery, biosynthesis, and possible functions | journal = Annual Review of Microbiology | volume = 62 | pages = 235–51 | year = 2008 | pmid = 18729733 | doi = 10.1146/annurev.micro.62.081307.162750 }}</ref> Der er blevet fundet proteiner, der binder specifikt til denne base.<ref name=Cross1999>{{cite journal | author = Cross M, Kieft R, Sabatini R, Wilm M, de Kort M, van der Marel GA, van Boom JH, van Leeuwen F, Borst P | title = The modified base J is the target for a novel DNA-binding protein in kinetoplastid protozoans | journal = The EMBO Journal | volume = 18 | issue = 22 | pages = 6573–6581 | year = 1999 | pmid = 10562569 | pmc = 1171720 | doi = 10.1093/emboj/18.22.6573 }}</ref><ref name=DiPaolo2005>{{cite journal | author = DiPaolo C, Kieft R, Cross M, Sabatini R | title = Regulation of trypanosome DNA glycosylation by a SWI2/SNF2-like protein | journal = Mol Cell | volume = 17 | issue = 3 | pages = 441–451 | year = 2005 | pmid = 15694344 | doi = 10.1016/j.molcel.2004.12.022 }}</ref><ref name=Vainio2009>{{cite journal | author = Vainio S, Genest PA, ter Riet B, van Luenen H, Borst P | title = Evidence that J-binding protein 2 is a thymidine hydroxylase catalyzing the first step in the biosynthesis of DNA base J | journal = Molecular and biochemical parasitology | volume = 164 | issue = 2 | pages = 157–61 | year = 2009 | pmid = 19114062 | doi = 10.1016/j.molbiopara.2008.12.001 }}</ref> Disse proteiner lader til at være en fjern slægtning til det Tet1-[[onkogen]], der er involveret i patogenesen af [[akut myeloid leukæmi]].<ref name=Iyer2009>{{cite journal | author = Iyer LM, Tahiliani M, Rao A, Aravind L | title = Prediction of novel families of enzymes involved in oxidative and other complex modifications of bases in nucleic acids | journal = Cell Cycle | volume = 8 | issue = 11 | pages = 1698–1710 | year = 2009 | pmid = 19411852 | pmc = 2995806 | doi = 10.4161/cc.8.11.8580 }}</ref> J lader til at opføre sig som et terminationssignal for [[RNA polymerase II]].<ref name=van_Luenen2012>{{cite journal | author = van Luenen HG, Farris C, Jan S, Genest PA, Tripathi P, Velds A, Kerkhoven RM, Nieuwland M, Haydock A, Ramasamy G, Vainio S, Heidebrecht T, Perrakis A, Pagie L, van Steensel B, Myler PJ, Borst P | title = Leishmania | journal = Cell | volume = 150 | issue = 5 | pages = 909–921 | year = 2012 | pmid = 22939620 | pmc = 3684241 | doi = 10.1016/j.cell.2012.07.030 }}</ref><ref name=Hazelbaker2012>{{cite journal | author = Hazelbaker DZ, Buratowski S | title = Transcription: base J blocks the way | journal = Curr Biol | volume = 22 | issue = 22 | pages = R960–2 | year = 2012 | pmid = 23174300 | pmc = 3648658 | doi = 10.1016/j.cub.2012.10.010 }}</ref>
 
=== Riller ===
<!-- "Grooves" oversættes i det følgende som "riller. Dobbelttjek gerne at dette er den korrekte terminologi -->
[[FileFil:DNA-ligand-by-Abalone.png|left|thumb|Store og små riller i DNA. Små riller er bindingssted for farven [[Hoechst-farve|Hoechst 33258]].]]
To heliske strenge udgør DNA'ens rygrad. En anden dobbelthelix kan findes ved at følge rummene, eller rillerne (på engelsk kaldet "''grooves''"), mellem strengene. Disse hulrum støder op til baseparrene og kan udgøre et [[bindingssted]]. Da strengene ikke ligger symmetrisk i forhold til hinanden, er rillerne af forskellig størrelse. En rille, den store rille, er 22 &nbsp;[[Ångstrøm|Å]] bred, mens den anden, den lille rille, er 12&nbsp;Å bred.<ref>{{cite journal | author = Wing R, Drew H, Takano T, Broka C, Tanaka S, Itakura K, Dickerson RE | title = Crystal structure analysis of a complete turn of B-DNA | journal = Nature | volume = 287 | issue = 5784 | pages = 755–8 | year = 1980 | pmid = 7432492 | doi = 10.1038/287755a0 | bibcode = 1980Natur.287..755W }}</ref> Bredden af den store rille medfører, at kanterne på baserne er mere tilgængelige i den store rille end i den lille. Som følge heraf får proteiner såsom [[transskriptionsfaktor]]er, der kan binde til specifikke sekvenser i dobbelt-strenget DNA, normalt kontakt med siderne af de baser, der er blotlagt i den store rille.<ref name="Pabo1984">{{cite journal | author = Pabo CO, Sauer RT | title = Protein-DNA recognition | journal = Annu Rev Biochem | volume = 53 | pages = 293–321 | year = 1984 | pmid = 6236744 | doi = 10.1146/annurev.bi.53.070184.001453 }}</ref> Denne situation varierer i nogle usædvanlige DNA-konformere i cellen, men navnene "store" og "lille" rille er til for at reflektere de forskelle i størrelse, der ville ses, hvis DNA'en drejedes tilbage til almindelig B-form.
 
=== Baseparring ===
{{uddybende|Basepar}}
I en DNA-dobbelthelix binder hver type nukleobase på en streng kun til en bestemt type nukleobase på den anden streng. Dette kaldes komplementær [[basepar]]ring. Her danner puriner [[hydrogenbinding]]er til pyrimidiner, idet adenin kun binder til thymin via to hydrogenbindinger, og cytosin kun binder til guanin via tre hydrogenbindinger. Dette arrangement af to nukleotider, der binder sig sammen på tværs af en dobbelthelix, kaldes et basepar. Da hydrogenbindinger ikke er [[kovalent binding|kovalente]], kan de brydes og genforenes relativt nemt. DNA's to strenge i en dobbelthelix kan derfor trækkes fra hinanden som en lynlås, enten ved mekanisk kraft eller høje [[temperatur]]er.<ref>{{cite journal | author = Clausen-Schaumann H, Rief M, Tolksdorf C, Gaub HE | title = Mechanical stability of single DNA molecules | journal = Biophys J | volume = 78 | issue = 4 | pages = 1997–2007 | year = 2000 | pmid = 10733978 | pmc = 1300792 | doi = 10.1016/S0006-3495(00)76747-6 | bibcode = 2000BpJ....78.1997C }}</ref> Som følge af denne komplementaritet duplikeres al information i den dobbelt-strengede sekvens i en DNA-helix på hver streng, hvilket er livsvigtigt i DNA-replikation. Denne reversible og specifikke interaktion imellem komplementære basepar er kritisk for alle DNA's funktioner i levende organismer.<ref name=Alberts/>
Linje 41:
{| border="0" border="0" cellpadding="2" cellspacing="0" style="width:230px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|-
|[[FileFil:Base pair GC.svg|282px]]
|}
{| border="0" border="0" cellpadding="2" cellspacing="0" style="width:230px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|-
|[[FileFil:Base pair AT.svg|282px]]
|}
<div style="border: none; width:282px;"><div class="thumbcaption">Øverst: et '''GC'''-basepar med tre [[hydrogenbinding]]er. Nederst: et '''AT'''-basepar med to hydrogenbindinger. Ikke-kovalente hydrogenbindinger mellem parrene vises som stiplede linjer.</div></div></div>
Linje 58:
I laboratoriet kan styrken af denne interaktion måles ved at finde den temperatur, der er nødvendig for at bryde hydrogenbindingerne, deres [[DNA-smeltning|smeltetemperatur]] (også kaldet ''T<sub>m</sub>''-værdien). Når alle baseparrene i en DNA-dobbelthelix smelter, adskilles og eksisterer strengene i opløsning som to fuldstændigt uafhængige molekyler. Disse enkeltstrengede DNA-molekyler (''ssDNA'') har ingen almindelig form, men nogle konformere er mere stabile end andre.<ref>{{cite journal | author = Isaksson J, Acharya S, Barman J, Cheruku P, Chattopadhyaya J | title = Single-stranded adenine-rich DNA and RNA retain structural characteristics of their respective double-stranded conformations and show directional differences in stacking pattern | journal = Biochemistry | volume = 43 | issue = 51 | pages = 15996–6010 | year = 2004 | pmid = 15609994 | doi = 10.1021/bi048221v }}</ref>
 
=== Sense og antisense ===
{{uddybende|Sense (molekylærbiologi)}}
En DNA-sekvens kaldes "sense" hvis dens sekvens er den samme som en [[mRNA|messenger RNA]]-kopi, der translateres til protein.<ref>[http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/newsletter/misc/DNA.html Designation of the two strands of DNA] JCBN/NC-IUB Newsletter 1989. Retrieved 7 May 2008</ref> Sekvensen på den modsatte streng kaldes "antisense"-sekvensen. Både sense- og antisense-sekvenser kan eksistere på forskellige dele af den samme DNA-streng (dvs. begge strenge kan indeholde både sense- og antisensesekvenser). Antisense-RNA-sekvenser produceres i både prokaryoter og eukaryoter, men disse RNA'ers funktioner er ikke helt visse.<ref>{{cite journal | author = Hüttenhofer A, Schattner P, Polacek N | title = Non-coding RNAs: hope or hype? | journal = Trends Genet | volume = 21 | issue = 5 | pages = 289–97 | year = 2005 | pmid = 15851066 | doi = 10.1016/j.tig.2005.03.007 }}</ref> En mulighed er, at antisense-RNA er involveret i reguleringen af [[genudtryk]] gennem RNA-RNA-baseparring.<ref>{{cite journal | author = Munroe SH | title = Diversity of antisense regulation in eukaryotes: multiple mechanisms, emerging patterns | journal = J Cell Biochem | volume = 93 | issue = 4 | pages = 664–71 | year = 2004 | pmid = 15389973 | doi = 10.1002/jcb.20252 }}</ref>
 
Nogle få DNA-sekvenser i prokaryoter og eukaryoter, og flere i [[plasmid]]er og [[virus (biologi)|vira]], slører grænsen mellem sense- og antisense-strenge ved at have [[overlappende gen]]er.<ref>{{cite journal | author = Makalowska I, Lin CF, Makalowski W | title = Overlapping genes in vertebrate genomes | journal = Comput Biol Chem | volume = 29 | issue = 1 | pages = 1–12 | year = 2005 | pmid = 15680581 | doi = 10.1016/j.compbiolchem.2004.12.006 }}</ref> I disse tilfælde fungerer nogle DNA-sekvenser dobbelt, og koder et protein når de læser langs en streng, og et andet protein når de læses i den modsatte retning langs den anden streng. I [[bakterie]]r kan dette overlap være involveret i reguleringen af gentransskription,<ref>{{cite journal | author = Johnson ZI, Chisholm SW | title = Properties of overlapping genes are conserved across microbial genomes | journal = Genome Res | volume = 14 | issue = 11 | pages = 2268–72 | year = 2004 | pmid = 15520290 | pmc = 525685 | doi = 10.1101/gr.2433104 }}</ref> mens overlappende gener hos vira kan øge mængden af information, der kan indkodes i det lille virale genom.<ref>{{cite journal | author = Lamb RA, Horvath CM | title = Diversity of coding strategies in influenza viruses | journal = Trends Genet | volume = 7 | issue = 8 | pages = 261–6 | year = 1991 | pmid = 1771674 | doi = 10.1016/0168-9525(91)90326-L }}</ref>
 
=== Supercoiling ===
{{uddybende|DNA-supercoiling}}
DNA kan snos som et reb ved en proces kaldet [[DNA supercoil]]ing. I DNA'ens "afslappede" tilstand cirkler en streng normalt omkring dobbelthelixens akse en gang hvert 10,4 basepar, men hvis DNA'en snos, bliver strengene strammere eller løsere bundet.<ref>{{cite journal | author = Benham CJ, Mielke SP | title = DNA mechanics | journal = Annu Rev Biomed Eng | volume = 7 | pages = 21–53 | year = 2005 | pmid = 16004565 | doi = 10.1146/annurev.bioeng.6.062403.132016 }}</ref> Hvis DNA'en snos i samme retning som helixen, kaldes dette positiv supercoiling, og baserne holdes strammere sammen. Hvis de snos i den modsatte retning, kaldes det negativ supercoiling, og baserne kan nemmere adskilles. I naturen har den meste DNA en let negativ supercoiling, der skyldes [[enzym]]erne [[topoisomerase]].<ref name=Champoux>{{cite journal | author = Champoux JJ | title = DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism | journal = Annu Rev Biochem | volume = 70 | pages = 369–413 | year = 2001 | pmid = 11395412 | doi = 10.1146/annurev.biochem.70.1.369 }}</ref> Disse enzymer behøves også for at aflaste de snoede spændinger, der introduceres i DNA-strenge under processer såsom [[transskription (biologi)|transskription]] og [[DNA-replikation]].<ref name=Wang>{{cite journal | author = Wang JC | title = Cellular roles of DNA topoisomerases: a molecular perspective | journal = Nature Reviews Molecular Cell Biology | volume = 3 | issue = 6 | pages = 430–40 | year = 2002 | pmid = 12042765 | doi = 10.1038/nrm831 }}</ref>
 
=== Alternative DNA-strukturer ===
[[FileFil:A-DNA, B-DNA and Z-DNA.png|thumb|right|Fra venstre mod højre: strukturerne for A-, B- og Z-DNA]]
DNA eksisterer i mange mulige [[Rotamer|konformere]], der inkluderer [[A-DNA]], B-DNA og [[Z-DNA]], selvom kun B-DNA og Z-DNA er blevet direkte observeret i funktionelle organismer.<ref name=Ghosh/> Den konformer som DNA indtager afhænger af hydratiseringsniveauet, DNA-sekvensen, mængden og retningen af supercoiling, kemiske modifikationer af baserne, typen og koncentrationen af metal[[ion]]er, såvel som tilstedeværelsen af [[polyamin]]er i opløsningen.<ref>{{cite journal | author = Basu HS, Feuerstein BG, Zarling DA, Shafer RH, Marton LJ | title = Recognition of Z-RNA and Z-DNA determinants by polyamines in solution: experimental and theoretical studies | journal = J Biomol Struct Dyn | volume = 6 | issue = 2 | pages = 299–309 | year = 1988 | pmid = 2482766 | doi = 10.1080/07391102.1988.10507714 }}</ref>
 
De første offentliggjorte rapporter om A-DNA-røntgendiffraktionsmønstre <!-- "X-ray diffraction patterns" --> – såvel som B-DNA – brugte analyser baseret på [[Patterson-metoden]], der kun gav begrænsede mængder strukturel information om orienterede DNA-fibre.<ref>{{cite journal |author=Franklin RE, Gosling RG |title=The Structure of Sodium Thymonucleate Fibres I. The Influence of Water Content |journal=Acta Crystallogr |volume=6 |issue=8–9 |pages=673–7 |date=6. marts 1953 |doi=10.1107/S0365110X53001939 |url=http://journals.iucr.org/q/issues/1953/08-09/00/a00979/a00979.pdf}}<br />{{cite journal |author=Franklin RE, Gosling RG |title=The structure of sodium thymonucleate fibres. II. The cylindrically symmetrical Patterson function |journal=Acta Crystallogr |volume=6 |issue=8–9 |pages=678–85 |year=1953|doi=10.1107/S0365110X53001940 }}</ref><ref name=NatFranGos>{{cite journal | author = Franklin RE, Gosling RG | title = Molecular Configuration in Sodium Thymonucleate. Franklin R. and Gosling R.G | journal = Nature | volume = 171 | issue = 4356 | pages = 740–1 | year = 1953 | pmid = 13054694 | doi = 10.1038/171740a0 | url = http://www.nature.com/nature/dna50/franklingosling.pdf | format = PDF | bibcode = 1953Natur.171..740F }}</ref> En alternativ analyse blev efterfølgende foreslået af Wilkins ''et al.'', i 1953, for ''in vivo'' B-DNA røntgendiffraktionsmønstre <!-- "X-ray diffraction/scattering patterns" --> af højt hydratiserede DNA-fibre i form af kvadrater af [[Besselfunktion]]er.<ref name=NatWilk>{{cite journal | author = Wilkins MH, Stokes AR, Wilson HR | title = Molecular Structure of Deoxypentose Nucleic Acids | journal = Nature | volume = 171 | issue = 4356 | pages = 738–740 | year = 1953 | pmid = 13054693 | doi = 10.1038/171738a0 | url = http://www.nature.com/nature/dna50/wilkins.pdf | format = PDF | bibcode = 1953Natur.171..738W }}</ref> I den samme journal præsenterede [[James Watson]] og [[Francis Crick]] deres molekylærmodelleringsanalyse af DNA-røntgendiffraktionsmønstrene for at sandsynliggøre at strukturen var en dobbelthelix.<ref name=FWPUB/>
 
Selvom "B-DNA-formen" er den mest almindelige under de forhold, der findes i celler,<ref>{{cite journal | author = Leslie AG, Arnott S, Chandrasekaran R, Ratliff RL | title = Polymorphism of DNA double helices | journal = J. Mol. Biol. | volume = 143 | issue = 1 | pages = 49–72 | year = 1980 | pmid = 7441761 | doi = 10.1016/0022-2836(80)90124-2 }}</ref> er den ikke en veldefineret konformer, men en familie af relaterede DNA-konformere,<ref>{{cite journal |author=Baianu, I.C. |title=Structural Order and Partial Disorder in Biological systems|journal= Bull. Math. Biol. |volume= 42 |issue=4 |pages=137–141|year=1980 |doi=10.1016/s0092-8240(80)80083-8}} http://cogprints.org/3822/</ref> der finder sted på de høje hydratiseringsniveauer i levende celler. Deres tilsvarende røntgendiffraktions- og spredningsmønstre er karakteristiske for molekylære [[Parakrystallin|parakrystaller]] med en signifikant grad af uorden.<ref>Hosemann R., Bagchi R.N., ''Direct analysis of diffraction by matter'', North-Holland Publs., Amsterdam&nbsp;– New York, 1962.</ref><ref>{{cite journal|author=Baianu, I.C. |title=X-ray scattering by partially disordered membrane systems|journal=Acta Crystallogr A |volume=34 |issue=5 |pages=751–753|year=1978|doi=10.1107/S0567739478001540|bibcode = 1978AcCrA..34..751B }}</ref>
 
Sammenlignet med B-DNA er A-DNA-formen en bredere, højrehåndet spiral, med en overfladisk, bred lille rille og en smallere, dybere stor rille. A-formen fremkommer under ikke-fysiologiske forhold i delvist dehydrerede DNA-prøver, mens den i cellen kan produceres i hybridparringer af DNA- og RNA-strenge, såvel som i enzym-DNA-komplekser.<ref>{{cite journal | author = Wahl MC, Sundaralingam M | title = Crystal structures of A-DNA duplexes | journal = Biopolymers | volume = 44 | issue = 1 | pages = 45–63 | year = 1997 | pmid = 9097733 | doi = 10.1002/(SICI)1097-0282(1997)44:1<45::AID-BIP4>3.0.CO;2-# }}</ref><ref>{{cite journal | author = Lu XJ, Shakked Z, Olson WK | title = A-form conformational motifs in ligand-bound DNA structures | journal = J. Mol. Biol. | volume = 300 | issue = 4 | pages = 819–40 | year = 2000 | pmid = 10891271 | doi = 10.1006/jmbi.2000.3690 }}</ref> Segmenter af DNA, hvor baserne er blevet kemisk modificeret ved [[methylering]], kan undergå en større forandring i konformer og indtage [[Z-DNA|Z-form]]. Her drejer strengene omkring den heliske akse i en venstrehåndet spiral, det modsatte af den mere almindelige B-form.<ref>{{cite journal | author = Rothenburg S, Koch-Nolte F, Haag F | title = DNA methylation and Z-DNA formation as mediators of quantitative differences in the expression of [[allele]]s | journal = Immunol Rev | volume = 184 | pages = 286–98 | year = 2001 | pmid = 12086319 | doi = 10.1034/j.1600-065x.2001.1840125.x }}</ref> Disse usædvanlige strukturer kan genkendes på specifikke Z-DNA-bindingsproteiner og kan være involveret i reguleringen af transskription.<ref>{{cite journal | author = Oh DB, Kim YG, Rich A | title = Z-DNA-binding proteins can act as potent effectors of gene expression in vivo | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. | volume = 99 | issue = 26 | pages = 16666–71 | year = 2002 | pmid = 12486233 | pmc = 139201 | doi = 10.1073/pnas.262672699 | bibcode = 2002PNAS...9916666O }}</ref>
 
=== Alternativ DNA-kemi ===
I en række år har [[Astrobiologi|exobiologer]] foreslået, at der findes en [[skyggebiosfære]], en postuleret mikrobiel biosfære af Jorden som anvender radikalt anderledes biokemiske og molekylære processer end det liv der kendes i dag. Et af forslagene var eksistensen af livsformer, som bruger [[Arsen-DNA|arsen i stedet for fosfor i DNA]]. En rapport om denne mulighed i bakterien [[GFAJ-1]] blev bebudet i 2010,<ref name='arsenic extremophile'>{{Kilde nyheder |first=Jason |last=Palmer |title=Arsenic-loving bacteria may help in hunt for alien life |date=2. december 2010 |url=http://www.bbc.co.uk/news/science-environment-11886943 |work=BBC News |accessdate=2. december 2010}}</ref><ref name='arsenic extremophile'/><ref name="Space">{{Kilde nyheder |last=Bortman |first=Henry |title=Arsenic-Eating Bacteria Opens New Possibilities for Alien Life |date=2. december 2010 |url=http://www.space.com/scienceastronomy/arsenic-bacteria-alien-life-101202.html |website=Space.com |accessdate=2. december 2010}}</ref> selvom forskningen var omstridt,<ref name="Space"/><ref>{{cite journal |first=Alla |title=Arsenic-eating microbe may redefine chemistry of life |date=2. december 2010 |url=http://www.nature.com/news/2010/101202/full/news.2010.645.html |journal=Nature News |doi=10.1038/news.2010.645 |last=Katsnelson}}</ref> og beviserne peger i retning af, at bakterien aktivt forhindrer inkorporeringen af [[arsen]] i DNA-rygraden og andre biomolekyler.<ref name="Nature">{{cite journal |last=Cressey |first=Daniel |title='Arsenic-life' Bacterium Prefers Phosphorus after all |date=3. oktober 2012 |journal=Nature News |doi=10.1038/nature.2012.11520}}</ref>
 
=== Quadruplexstrukturer ===
{{uddybende|G-quadruplex}}
[[FileFil:Parallel telomere quadruple.png|thumb|right|DNA-quadruplex dannet af [[telomer]]gentagelser. DNA-rygradens gentagede konformer er meget anderledes fra den typiske DNA-helix.<ref>Created from [http://ndbserver.rutgers.edu/atlas/xray/structures/U/ud0017/ud0017.html NDB UD0017]</ref>]]
I enderne af de lineære kromosomer findes specialiserede DNA-regioner kaldet [[telomer]]er. Disse regioners centrale funktion er at tillade cellen at replikere kromosomender ved brug af enzymet [[telomerase]], da enzymerne som normalt replikerer DNA ikke kan kopiere de yderste 3′-ender af kromosomer.<ref name=Greider>{{cite journal | author = Greider CW, Blackburn EH | title = Identification of a specific telomere terminal transferase activity in Tetrahymena extracts | journal = Cell | volume = 43 | issue = 2 Pt 1 | pages = 405–13 | year = 1985 | pmid = 3907856 | doi = 10.1016/0092-8674(85)90170-9 }}</ref> Disse specialiserede 'kromosomdæksler' <!-- "chromosome caps" --> hjælper også med at beskytte DNA-enderne og stoppe [[DNA-reparation]]ssystemerne i cellen fra at behandle dem som skade, der skal repareres.<ref name=Nugent>{{cite journal | author = Nugent CI, Lundblad V | title = The telomerase reverse transcriptase: components and regulation | journal = Genes Dev | volume = 12 | issue = 8 | pages = 1073–85 | year = 1998 | pmid = 9553037 | doi = 10.1101/gad.12.8.1073 }}</ref> I menneskeceller har telomerer normalt en længde på enkelt-strenget DNA indeholdende flere tusinde gentagelser af en simpel TTAGGG-sekvens.<ref>{{cite journal | author = Wright WE, Tesmer VM, Huffman KE, Levene SD, Shay JW | title = Normal human chromosomes have long G-rich telomeric overhangs at one end | journal = Genes Dev | volume = 11 | issue = 21 | pages = 2801–9 | year = 1997 | pmid = 9353250 | pmc = 316649 | doi = 10.1101/gad.11.21.2801 }}</ref>
 
Linje 90:
Udover disse stablede strukturer danner telomerer også store loopende strukturer kaldet telomerloops, eller T-loops. Her krøller den enkelt-strengede DNA sig sammen til en lang cirkel stabiliseret af telomerbindende proteiner.<ref>{{cite journal | author = Griffith JD, Comeau L, Rosenfield S, Stansel RM, Bianchi A, Moss H, de Lange T | title = Mammalian telomeres end in a large duplex loop | journal = Cell | volume = 97 | issue = 4 | pages = 503–14 | year = 1999 | pmid = 10338214 | doi = 10.1016/S0092-8674(00)80760-6 }}</ref> I den sidste ende af T-loopet holdes den enkelt-strengede telomer-DNA på en region af dobbelt-strenget DNA af den telomerstreng, der splitter den dobbeltheliske DNA og baseparring til en af de to strenge. Denne [[Trippel-strenget DNA|trippel-strengede]] struktur kaldes et [[D-loop]].<ref name=Burge/>
 
=== Forgrenet DNA ===
<div class="thumb tright" style="background:#f9f9f9; border:1px solid #ccc; margin:0.5em;">
{| border="0" border="0" cellpadding="2" cellspacing="0" style="width:200px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|[[FileFil:Branch-dna-single.svg|95px]]
|[[FileFil:Branch-DNA-multiple.svg|95px]]
|-
|align=center|Enkelt gren
Linje 103:
DNA "[[DNA-ender|flosser]]", når ikke-komplementære regioner eksisterer i enden af en ellers komplementær dobbelt-strenget DNA. Forgrenet DNA kan dog opstå, hvis en tredje streng af DNA introduceres og indeholder tilstødende regioner i stand til at [[Hybridisering|hybridisere]] med de flossede regioner i den allerede eksisterende dobbelt-streng. Selvom det mest simple eksempel på forgrenet DNA kun involverer tre DNA-strenge, er det også muligt at skabe komplekser med yderligere strenge og flere grene.<ref>{{cite journal | author = Seeman NC | title = DNA enables nanoscale control of the structure of matter | journal = Q. Rev. Biophys. | volume = 38 | issue = 4 | pages = 363–71 | year = 2005 | pmid = 16515737 | pmc = 3478329 | doi = 10.1017/S0033583505004087 }}</ref> Forgrenet DNA kan bruges i [[nanoteknologi]] til at konstruere geometriske former.
 
== Kemiske modifikationer og ændret DNA-pakning ==
=== Basemodifikationer og DNA-pakning ===
<div class="thumb tright" style="background:#f9f9f9; border:1px solid #ccc; margin:0.5em;">
{| border="0" border="0" cellpadding="2" cellspacing="0" style="width:300px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|-
|[[FileFil:Cytosin.svg|75px]]
|[[FileFil:5-Methylcytosine.svg|95px]]
|[[FileFil:Thymin.svg|97px]]
|-
|align=center|[[cytosin]]
Linje 121:
For at tage et eksempel, producerer cytosinmethylering [[5-Methylcytosin|5-methylcytosin]], som er vigtigt for [[Lyons hypotese|X-kromosominaktivering]].<ref>{{cite journal | author = Klose RJ, Bird AP | title = Genomic DNA methylation: the mark and its mediators | journal = Trends Biochem Sci | volume = 31 | issue = 2 | pages = 89–97 | year = 2006 | pmid = 16403636 | doi = 10.1016/j.tibs.2005.12.008 }}</ref> Det gennemsnitlige methyleringsniveau varierer mellem organismer&nbsp;– ormen ''[[Caenorhabditis elegans]]'' har ingen cytosinmethylering, mens [[hvirveldyr]] har højere niveauer, med 5-methylcytosin i op til 1% af deres DNA .<ref>{{cite journal | author = Bird A | title = DNA methylation patterns and epigenetic memory | journal = Genes Dev | volume = 16 | issue = 1 | pages = 6–21 | year = 2002 | pmid = 11782440 | doi = 10.1101/gad.947102 }}</ref> På trods af 5-methylcytosins vigtighed har det den ulempe, at det kan [[deaminering|deamineres]] til en thyminbase, hvilket gør methylerede cytosiner særligt sårbare over for [[mutation]]er.<ref>{{cite journal | author = Walsh CP, Xu GL | title = Cytosine methylation and DNA repair | journal = Curr Top Microbiol Immunol | volume = 301 | pages = 283–315 | year = 2006 | pmid = 16570853 | doi = 10.1007/3-540-31390-7_11 | isbn = 3-540-29114-8 | series = Current Topics in Microbiology and Immunology }}</ref> Blandt andre basemodifikationer er adeninmethylering i bakterier, tilstedeværelsen af [[5-hydroxymethylcytosin]] i [[hjerne]]n<ref>{{cite journal | author = Kriaucionis S, Heintz N | title = The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain | journal = Science | volume = 324 | issue = 5929 | pages = 929–30 | year = 2009 | pmid = 19372393 | pmc = 3263819 | doi = 10.1126/science.1169786 | bibcode = 2009Sci...324..929K }}</ref> og [[glykosylering]]en af uracil til "J-basen" i [[kinetoplastider]].<ref>{{cite journal | author = Ratel D, Ravanat JL, Berger F, Wion D | title = N6-methyladenine: the other methylated base of DNA | journal = BioEssays | volume = 28 | issue = 3 | pages = 309–15 | year = 2006 | pmid = 16479578 | pmc = 2754416 | doi = 10.1002/bies.20342 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Gommers-Ampt JH, Van Leeuwen F, de Beer AL, Vliegenthart JF, Dizdaroglu M, Kowalak JA, Crain PF, Borst P | title = beta-D-glucosyl-hydroxymethyluracil: a novel modified base present in the DNA of the parasitic protozoan T. brucei | journal = Cell | volume = 75 | issue = 6 | pages = 1129–36 | year = 1993 | pmid = 8261512 | doi = 10.1016/0092-8674(93)90322-H }}</ref>
 
=== Beskadigelse ===
[[FileFil:Benzopyrene DNA adduct 1JDG.png|thumb|right|Et [[kovalent binding|kovalent]] [[addukt]] mellem en metabolsk aktiveret form af [[Benzo(a)pyren|benzo[''a'']pyren]] – det store [[mutagen]] i [[Tobaksrygning|tobaksrøg]] – og DNA.<ref>Created from [http://www.rcsb.org/pdb/cgi/explore.cgi?pdbId=1JDG PDB 1JDG]</ref>]]
 
DNA kan beskadiges af mange typer [[mutagen]]er, som kan ændre DNA-sekvensen. Blandt disse mutagener er [[oxidationsmiddel|oxidations-]] og [[Alkylering|alkyleringsmidleralkylering]]smidler, såvel som højenergi-[[elektromagnetisk stråling]] såsom [[ultraviolet]] lys og [[røntgenstråling]]. Typen af skade på DNA'en afhænger af typen af mutagen. For eksempel kan UV-lys beskadige DNA ved at producere [[thymindimer]]er, som er krydsbindinger mellem pyrimidinbaser.<ref>{{cite journal | author = Douki T, Reynaud-Angelin A, Cadet J, Sage E | title = Bipyrimidine photoproducts rather than oxidative lesions are the main type of DNA damage involved in the genotoxic effect of solar UVA radiation | journal = Biochemistry | volume = 42 | issue = 30 | pages = 9221–6 | year = 2003 | pmid = 12885257 | doi = 10.1021/bi034593c }}</ref> Omvendt forårsager oxidanter såsom [[Radikal (kemi)|frie radikale]] eller [[brintoverilte]] flere typer skade, heriblandt basemodifikationer, særligt af guanosin, og dobbelt-streng-brud.<ref>{{cite journal | author = Cadet J, Delatour T, Douki T, Gasparutto D, Pouget JP, Ravanat JL, Sauvaigo S | title = Hydroxyl radicals and DNA base damage | journal = Mutat Res | volume = 424 | issue = 1–2 | pages = 9–21 | year = 1999 | pmid = 10064846 | doi = 10.1016/S0027-5107(99)00004-4 }}</ref> En typisk menneskecelle indeholder omkring 150.000 baser, som har lidt oxidativ skade.<ref>{{cite journal | author = Beckman KB, Ames BN | title = Oxidative decay of DNA | journal = J. Biol. Chem. | volume = 272 | issue = 32 | pages = 19633–6 | year = 1997 | pmid = 9289489 | doi = 10.1074/jbc.272.32.19633 }}</ref> Af disse oxidative læsioner er de farligste dobbelt-strengede brud, da disse er svære at reparere og kan producere [[punktmutation]]er, [[Genetisk indsættelse|indsættelser]] og [[Deletion (genetik)|deletiondeletioner]]er fra DNA-sekvensen, såvel som [[kromosomal translokation|kromosomale translokationer]].<ref>{{cite journal | author = Valerie K, Povirk LF | title = Regulation and mechanisms of mammalian double-strand break repair | journal = Oncogene | volume = 22 | issue = 37 | pages = 5792–812 | year = 2003 | pmid = 12947387 | doi = 10.1038/sj.onc.1206679 }}</ref> Disse mutationer kan forårsage [[kræft]]. På grund af iboende begrænsninger i DNA-reparationsmekanismerne ville alle mennesker, såfremt de levede længe nok, før eller siden udvikle kræft.<ref name=Weinberg>{{Kilde nyheder
| url = http://www.nytimes.com/2010/12/28/health/28cancer.html
| title = Unearthing Prehistoric Tumors, and Debate
Linje 130:
| date = 28. december 2010
| author = Johnson, George
|quote="If we lived long enough, sooner or later we all would get cancer."}}</ref><ref>{{cite book | author = Alberts, B, Johnson A, Lewis J | title = Molecular biology of the cell | publisher = Garland Science | location = New York | year = 2002 | edition = 4th | chapter = The Preventable Causes of Cancer | isbn = 0-8153-4072-9 | url = http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26897/ | quote = A certain irreducible background incidence of cancer is to be expected regardless of circumstances: mutations can never be absolutely avoided, because they are an inescapable consequence of fundamental limitations on the accuracy of DNA replication, as discussed in Chapter 5. If a human could live long enough, it is inevitable that at least one of his or her cells would eventually accumulate a set of mutations sufficient for cancer to develop. | oclc = |display-authors=etal}}</ref> DNA-skader, som opstår naturligt på grund af normale cellulære processer, der producerer reaktive oxygenforbindelser, cellulært vands hydrolytiske aktiviteter osv., sker også ofte. Selvom de fleste af disse skader repareres, kan der i enhver celle være nogle rester af DNA-skade på trods af reparationsprocesserne. Disse tilbageværende DNA-skader ophober sig med alderen i postmitotisk pattedyrsvæv. Denne ophobning lader til at være en vigtig underliggende årsag til aldring.<ref>Bernstein H, Payne CM, Bernstein C, Garewal H, Dvorak K (2008). Cancer and aging as consequences of un-repaired DNA damage. In: New Research on DNA Damages (Editors: Honoka Kimura and Aoi Suzuki) Nova Science Publishers, Inc., New York, Chapter 1, pp. 1–47. open access, but read only https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=43247 ISBN 978-1604565812</ref><ref>{{cite journal | author = Hoeijmakers JH | title = DNA damage, aging, and cancer | journal = N. Engl. J. Med. | volume = 361 | issue = 15 | pages = 1475–85 | date = October 2009 | pmid = 19812404 | doi = 10.1056/NEJMra0804615 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Freitas AA, de Magalhães JP | title = A review and appraisal of the DNA damage theory of ageing | journal = Mutat. Res. | volume = 728 | issue = 1–2 | pages = 12–22 | year = 2011 | pmid = 21600302 | doi = 10.1016/j.mrrev.2011.05.001 }}</ref>
 
Mange mutagener passer ind i rummet mellem to tilstødende basepar – dette kendes som ''[[interkalation (biokemi)|interkalation]]''. De fleste interkalatorer er [[aromaticitet|aromatiske]] og plane molekyler; eksempler kunne være [[ethidiumbromid]], [[akridin]]er, [[Daunorubicin|daunomycin]] og [[doxorubicin]]. En interkalator kan kun passe mellem basepar, hvis baserne separeres, og DNA-strengene forvrides ved at dreje dobbelthelixen ud. Dette hæmmer både transskriptionen og DNA-replikationen, hvilket skaber toxicitet og mutationer.<ref>{{cite journal | author = Ferguson LR, Denny WA | title = The genetic toxicology of acridines | journal = Mutat Res | volume = 258 | issue = 2 | pages = 123–60 | year = 1991 | pmid = 1881402 | doi = 10.1016/0165-1110(91)90006-H }}</ref> Som resultat heraf kan DNA-interkalatorer være [[carcinogen]]e, og i [[thalidomid]]s tilfælde, et [[teratogen]].<ref>{{cite journal | author = Stephens TD, Bunde CJ, Fillmore BJ | title = Mechanism of action in thalidomide teratogenesis | journal = Biochem Pharmacol | volume = 59 | issue = 12 | pages = 1489–99 | year = 2000 | pmid = 10799645 | doi = 10.1016/S0006-2952(99)00388-3 }}</ref> Andre, såsom [[benzo(a)pyren|benzo[''a'']pyrenoxid]] og [[aflatoksin]], danner DNA-addukter, som fremkalder fejl i replikationen.<ref>{{cite journal | author = Jeffrey AM | title = DNA modification by chemical carcinogens | journal = Pharmacol Ther | volume = 28 | issue = 2 | pages = 237–72 | year = 1985 | pmid = 3936066 | doi = 10.1016/0163-7258(85)90013-0 }}</ref> Alligevel bruges andre lignende toksiner også i [[kemoterapi]] til at sløve hurtigtvoksende kræftceller, pga. deres evne til at hæmme transskription og DNA-replikation.<ref>{{cite journal | author = Braña MF, Cacho M, Gradillas A, de Pascual-Teresa B, Ramos A | title = Intercalators as anticancer drugs | journal = Curr Pharm Des | volume = 7 | issue = 17 | pages = 1745–80 | year = 2001 | pmid = 11562309 | doi = 10.2174/1381612013397113 }}</ref>
 
== Biologiske funktioner ==
[[FileFil:Eukaryote DNA-en.svg|thumb|Beliggenheden af en eukaryots [[nuDNA|kerne-DNA]] i kromosomerne.]]
DNA forekommer normalt som lineære [[kromosom]]er i [[eukaryot]]er og cirkulære kromosomer i [[prokaryot]]er. Kromosomsættet i en celle udgør dens [[genom]]; [[menneskets genom]] har omkring 3 milliarder DNA-basepar arrangeret i 46 kromosomer.<ref>{{cite journal | author = Venter JC, Adams MD, Myers EW, Li PW, Mural RJ, Sutton GG | title = The sequence of the human genome | journal = Science | volume = 291 | issue = 5507 | pages = 1304–51 | year = 2001 | pmid = 11181995 | doi = 10.1126/science.1058040 | bibcode = 2001Sci...291.1304V |display-authors=etal}}</ref> Informationen i DNA ligger i [[DNA-sekvens|sekvensen]] af DNA-stykker, der kaldes [[gen]]er. [[Genetisk transmission|Transmission]] af genetisk information i gener opnås ved hjælp af komplementær baseparring. For eksempel kopieres DNA-sekvensen ved hjælp af transskription ind i en komplementær RNA-sekvens gennem tiltrækningen mellem DNA'en og de korrekte RNA-nukleotider når en celle bruger informationen i et gen. Normalt bruges denne RNA-kopi derefter til at skabe en matchende [[aminosyresekvens|proteinsekvens]] ved en proces kaldet [[Translation (genetik)|translation]], som afhænger af den samme interaktion mellem RNA-nukleotider. Alternativt kan en celle simpelthen kopiere sin genetiske information ved DNA-replikation.
 
=== Gener og genomer ===
{{uddybende|Arvemasse|Cellekerne|Kromatin|Kromosom|Gen|Ikke-kodende DNA}}
Genomisk DNA pakkes stramt og velordnet ved en proces kaldet [[DNA-kondensering]] for at passe ind i cellens små tilgængelige voluminer. I eukaryoter befinder DNA sig i [[cellekerne]]n, såvel som små mængder i [[mitokondrie]]r og [[grønkorn]]. I prokaryoter holdes DNA'en i et uregelmæssigt formet legeme i cytoplasmaen kaldet [[nukleoid]]en.<ref>{{cite journal | author = Thanbichler M, Wang SC, Shapiro L | title = The bacterial nucleoid: a highly organized and dynamic structure | journal = J Cell Biochem | volume = 96 | issue = 3 | pages = 506–21 | year = 2005 | pmid = 15988757 | doi = 10.1002/jcb.20519 }}</ref> Et genoms genetiske information ligger i generne, og det fuldstændige informationssæt i en organisme kaldes dens [[genotype]]. Et gen er en [[arv (biologi)|arvelig]] enhed og er en DNA-region, som påvirker en bestemt egenskab i en organisme. Gener indeholder en [[åben læseramme]], der kan transskriberes, såvel som [[regulerende sekvens]]er såsom [[promoter (biologi)|promotere]] og [[enhancer]]e, som kontrollerer transskriptionen af den åbne læseramme.
 
I mange [[art]]er er det kun en lille fraktion af den samlede [[genom]]sekvens der koder protein. For eksempel er det kun omkring 1,5% af det menneskelige genom, som består af proteinkodende [[exon]]er, mens over 50% af menneskelig DNA består af [[ikke-kodende DNA|ikke-kodende]] [[repetitiv sekvens|repetitive sekvenser]].<ref>{{cite journal | author = Wolfsberg TG, McEntyre J, Schuler GD | title = Guide to the draft human genome | journal = Nature | volume = 409 | issue = 6822 | pages = 824–6 | year = 2001 | pmid = 11236998 | doi = 10.1038/35057000 |bibcode = 2001Natur.409..824W }}</ref> Det har længe været en gåde hvorfor der findes så store mængder [[ikke-kodende DNA]] og ekstraordinære forskelle i [[genomstørrelse]] (kendt som ''[[C-værdi]]'') i eukaryotiske genomer arterne imellem.<ref>{{cite journal | author = Gregory TR | title = The C-value enigma in plants and animals: a review of parallels and an appeal for partnership | journal = Annals of Botany | volume = 95 | issue = 1 | pages = 133–46 | year = 2005 | pmid = 15596463 | doi = 10.1093/aob/mci009 }}</ref> Nogle af de DNA-sekvenser, som ikke koder protein, kan dog stadig kode funktionelle [[ikke-kodende RNA]]-molekyler, som er involverede i reguleringen af genekspression.<ref>{{cite journal | author = Birney E, Stamatoyannopoulos JA, Dutta A, Guigó R, Gingeras TR, Margulies EH | title = Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project | journal = Nature | volume = 447 | issue = 7146 | pages = 799–816 | year = 2007 | pmid = 17571346 | pmc = 2212820 | doi = 10.1038/nature05874 | bibcode = 2007Natur.447..799B |display-authors=etal}}</ref>
[[FileFil:T7 RNA polymerase.jpg|thumb|[[T7 RNA polymerase]] (blå) producerer en mRNA (grøn) fra en DNA-skabelon (orange).<ref>Skabt fra [http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1MSW PDB 1MSW]</ref>]]
Nogle ikke-kodende DNA-sekvenser spiller en strukturel rolle i kromosomer. [[Telomer]]er og [[centromer]]er indeholder typisk kun få gener, men er vigtige for kromosomernes funktion og stabilitet.<ref name=Nugent/><ref>{{cite journal | author = Pidoux AL, Allshire RC | title = The role of heterochromatin in centromere function | journal = Philosophical Transactions of the Royal Society B | volume = 360 | issue = 1455 | pages = 569–79 | year = 2005 | pmid = 15905142 | pmc = 1569473 | doi = 10.1098/rstb.2004.1611 }}</ref> En talstærk form for ikke-kodende DNA i mennesker er [[pseudogen]]er, som er kopier af gener, der er blevet deaktiveret af mutation.<ref>{{cite journal | author = Harrison PM, Hegyi H, Balasubramanian S, Luscombe NM, Bertone P, Echols N, Johnson T, Gerstein M | title = Molecular Fossils in the Human Genome: Identification and Analysis of the Pseudogenes in Chromosomes 21 and 22 | journal = Genome Res | volume = 12 | issue = 2 | pages = 272–80 | year = 2002 | pmid = 11827946 | pmc = 155275 | doi = 10.1101/gr.207102 }}</ref> Disse sekvenser er normalt kun molekylære fossiler, omend de en gang imellem kan fungere som råt [[genom|genetisk materiale]] for skabelsen af nye gener gennem en proces kendt som [[genduplikation]] og divergens.<ref>{{cite journal | author = Harrison PM, Gerstein M | title = Studying genomes through the aeons: protein families, pseudogenes and proteome evolution | journal = J Mol Biol | volume = 318 | issue = 5 | pages = 1155–74 | year = 2002 | pmid = 12083509 | doi = 10.1016/S0022-2836(02)00109-2 }}</ref>
 
En del [[Virus (biologi)|vira]] har DNA i deres arvemateriale – eksempelvis [[kopper]] (dobbeltstrenget) og [[lussingesyge]] (enkeltstrenget) – mens andre anvender RNA.<ref>Blehm Bidstrup, Bodil: ''Bioteknologi 4'', 2011, Forlaget Nucleus, s. 16-17</ref>
 
=== Transskription og translation ===
{{uddybende|Genetisk kode|Transskription (genetik)|Proteinsyntese}}
Et gen er en DNA-sekvens, der indeholder genetisk information og kan påvirke en organismes [[fænotype]]. Inde i et gen definerer sekvensen af baser langs en DNA-streng en [[messenger RNA]]-sekvens, som så til gengæld definerer en eller flere proteinsekvenser. Forholdet mellem geners nukleotidsekvenser og proteiners [[aminosyre]]sekvenser bestemmes af reglerne for [[Translation (biologi)|translation]], der overordnet kendes som den [[genetisk kode|genetiske kode]]. Den genetiske kode består af tre-bogstav 'ord' kaldet ''[[codon]]er'', der dannes fra en sekvens af tre nukleotider (f.eks. ACT, CAG, TTT).
 
Under transskriptionen kopieres et gens codoner ind i messenger-RNA (mRNA) ved hjælp af [[RNA-polymerase]] II. Denne RNA-kopi afkodes derefter af et [[ribosom]], som læser RNA-sekvensen ved at baseparre mRNA'et med [[transfer RNA]] (tRNA), som bærer aminosyrer. Da der er 4 baser i 3-bogstavkombinationer, er der 64 mulige codoner (4<sup>3</sup>&nbsp;kombinationer). Disse koder så de tyve [[standardaminosyre]]r og giver de fleste aminosyrer mere end ét muligt komplementært codon. Der findes også tre 'stop'-codoner ('nonsense'-codoner), der indikerer slutningen af kodningsregionen; disse er de tre codoner TAA, TGA og TAG, idet der ikke findes en tRNA, der er komplementær til disse.
 
Transskriptionen af DNA behøver dog ikke have dannelsen af mRNA, der skal translateres til et protein, som mål, da det ved transskriptionens producerede RNA i sig selv kan være målet. Dette kan f.eks. være tilfældet ved dannelsen af det omtalte tRNA (her bruges dog RNA-polymerase III frem for II) eller andre typer RNA, f.eks. precursor-[[miRNA]], der regulerer den cellulære proteinudtrykkelse ved processen [[RNA-interferens]].
 
=== Replikation ===
{{uddybende|DNA-replikation}}
<!-- [[File:DNA replication en.svg|thumb|right|DNA-replikation. Dobbelthelixen foldes ud af en [[helicase]] og [[topoisomerase]]]] -->
[[Celledeling]] er essentiel for at en organisme kan vokse, men når en celle deler sig, skal den replikere DNA'en i sit genom, så de to datterceller har samme genetiske information som deres forælder. DNA's dobbeltstrengede struktur sørger for en simpel mekanisme til [[DNA-replikation]]. Her separeres de to strenge, hvorefter hver strengs [[komplementær DNA|komplementære DNA]]-sekvens genskabes af et [[enzym]] kaldet [[DNA-polymerase]]. Dette enzym skaber den komplementære streng ved at finde den korrekte base gennem komplementær baseparring, og binder den derefter med den oprindelige streng. Da DNA-polymeraser kun kan udvide en DNA-streng i retningen 5′ til 3′, bruges andre mekanismer til at kopiere dobbelthelixens antiparallelle strenge.<ref>{{cite journal | author = Albà M | title = Replicative DNA polymerases | journal = Genome Biol | volume = 2 | issue = 1 | pages = reviews3002.1–reviews3002.4 | year = 2001 | pmid = 11178285 | pmc = 150442 | doi = 10.1186/gb-2001-2-1-reviews3002 | nopp = true }}</ref> På denne måde bestemmer basen på den gamle streng, hvilken base der dannes på den nye streng, og cellen ender op med en perfekt kopi af sin DNA.
 
=== Ekstracellulære nukleinsyrer ===
Nøgen ekstracellulær DNA (eDNA), som oftest udsendes ved celledød, er næsten allestedsnærværende i miljøet. Dets koncentration i jordbunden kan være helt op til 2 μg/L, og dets koncentration i naturlige vandmiljøer kan være helt op til 88 μg/L.<ref name=Tani_2010>{{cite book |last1=Tani |first1=Katsuji |last2=Nasu |first2=Masao |editor-last1=Kikuchi|editor-first1=Yo |editor-last2=Rykova |editor-first2=Elena Y. |title=Extracellular Nucleic Acids |publisher=Springer |date=2010 |pages=25–38 |chapter=Roles of Extracellular DNA in Bacterial Ecosystems |isbn=978-3-642-12616-1 }}</ref> Der er blevet spekuleret i flere mulige funktioner, som eDNA varetager: det kan være involveret i horisontal [[Horisontal genoverførsel|genoverførsel]];<ref name=Vlassov_2007>{{cite journal |last1=Vlassov |first1=V. V. |last2=Laktionov |first2=P. P. |last3=Rykova |first3=E. Y. |title=Extracellular nucleic acids |journal=BioEssays |date=2007 |volume=29 |pages=654–667 |doi=10.1002/bies.20604}}</ref> det kan levere næringsstoffer;<ref name=Finkel_2001>{{cite journal |last1=Finkel |first1=S. E. |last2=Kolter |first2=R. |title=DNA as a nutrient: novel role for bacterial competence gene homologs |journal=J. Bacteriol. |date=2001 |volume=183 |pages=6288–6293 |url=http://jb.asm.org/content/183/21/6288.full |doi=10.1128/JB.183.21.6288-6293.2001}}</ref> og det kan fungere som en buffer til at rekruttere eller titrere ioner eller antibiotika.<ref name=Mulcahy_2008>{{cite journal |last1=Mulcahy |first1=H. |last2=Charron-Mazenod |first2=L. |last3=Lewenza |first3=S. |title=Extracellular DNA chelates cations and induces antibiotic resistance in ''Pseudomonas aeruginosa'' biofilms |journal=PLoS Pathog. |date=2008 |volume=4 |page=e1000213 |url=http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1000213 |doi=10.1371/journal.ppat.1000213}}</ref> Ekstracellulær DNA opfører sig som en funktionel ekstracellulær matrixkomponent i en række bakteriearters [[biofilm]]. Det kan opføre sig som en genkendelsesfaktor til at regulere tilknytning og spredning af bestemte celletyper i biofilmen;<ref name=Berne_2010>{{cite journal |last1=Berne |first1=C. |last2=Kysela |first2=D. T. |last3=Brun |first3=Y. V. |title=A bacterial extracellular DNA inhibits settling of motile progeny cells within a biofilm |journal=Mol. Microbiol. |date=2010 |volume=77 |pages=815–829 |doi=10.1111/j.1365-2958.2010.07267.x |url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2958.2010.07267.x/full }}</ref> det kan bidrage til dannelsen af biofilm;<ref name=Whitchurch_2002>{{cite journal |last1=Whitchurch |first1=C. B. |last2=Tolker-Nielsen |first2=T. |last3=Ragas |first3=P. C. |last4=Mattick |first4=J. S. |title=Extracellular DNA required for bacterial biofilm formation |journal=Science |date=2002 |volume=295 |page=1487 |url=http://www.researchgate.net/profile/Cynthia_Whitchurch/publication/11503087_Extracellular_DNA_required_for_bacterial_biofilm_formation/links/02e7e516ca71ea7d6e000000.pdf |doi=10.1126/science.295.5559.1487}}</ref> og det kan bidrage til biofilmens fysiske styrke og modstandsdygtighed over for biologisk pres.<ref name=Hu_2012>{{Cite journal | doi = 10.1371/journal.pone.0051905| title = DNA Builds and Strengthens the Extracellular Matrix in Myxococcus xanthus Biofilms by Interacting with Exopolysaccharides| journal = PLoS ONE| volume = 7| issue = 12| pages = e51905| year = 2012| last1 = Hu | first1 = W. | last2 = Li | first2 = L. | last3 = Sharma | first3 = S. | last4 = Wang | first4 = J. | last5 = McHardy | first5 = I. | last6 = Lux | first6 = R. | last7 = Yang | first7 = Z. | last8 = He | first8 = X. | last9 = Gimzewski | first9 = J. K. | last10 = Li | first10 = Y. | last11 = Shi | first11 = W. |bibcode = 2012PLoSO...751905H }}</ref>
 
== Interaktion med proteiner ==
Alle DNA's funktioner afhænger af samspillet med proteiner. Disse proteininteraktioner kan være ikke-specifikke, eller proteinet kan binde sig specifikt til en enkelt DNA-sekvens. Enzymer kan også binde til DNA og af disse er polymeraserne, som kopierer DNA-basesekvensen i transskription og DNA-replikation, særligt vigtige.
 
=== DNA-bindende proteiner ===
<div class="thumb tleft" style="background:#f9f9f9; border:1px solid #ccc; margin:0.5em;">
{| border="0" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:260px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|-
|[[ImageFil:Nucleosome1.png|260px]]
|-
|
Linje 177:
<div style="border: none; width:260px;"><div class="thumbcaption">Interaktion mellem DNA (orange) og [[histon]]er (blå). Disse proteiners basiske aminosyrer binder til DNA'ens sure fosfatgrupper.</div></div></div>
 
Strukturelle proteiner, som binder DNA, er velkendte eksempler på ikke-specifikke interaktioner mellem DNA og protein. Inde i kromosomer holdes DNA i komplekser med strukturelle proteiner. Disse proteiner organiserer DNA'en i en kompakt struktur kaldet [[kromatin]]. I eukaryoter involverer denne struktur DNA-binding til et kompleks af små, basiske proteiner kaldet [[histon]]er, mens der er flere typer proteiner involveret i prokaryoter.<ref>{{cite journal | author = Sandman K, Pereira SL, Reeve JN | title = Diversity of prokaryotic chromosomal proteins and the origin of the nucleosome | journal = Cell Mol Life Sci | volume = 54 | issue = 12 | pages = 1350–64 | year = 1998 | pmid = 9893710 | doi = 10.1007/s000180050259 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Dame RT | title = The role of nucleoid-associated proteins in the organization and compaction of bacterial chromatin | journal = Mol. Microbiol. | volume = 56 | issue = 4 | pages = 858–70 | year = 2005 | pmid = 15853876 | doi = 10.1111/j.1365-2958.2005.04598.x }}</ref> Histonerne danner et pladeformet kompleks kaldet et [[nukleosom]], som indeholder to komplette drejninger af dobbelt-strenget DNA viklet omkring dets overflade. Disse ikke-specifikke interaktioner udgøres af [[ionbinding]]er mellem [[Base (kemi)|basiske]] grupper i histonerne og sure fosfatgrupper i DNA'ens sukker-fosfat-rygrad og er derfor mestendels uafhængige af basesekvensen.<ref>{{cite journal | author = Luger K, Mäder AW, Richmond RK, Sargent DF, Richmond TJ | title = Crystal structure of the nucleosome core particle at 2.8 A resolution | journal = Nature | volume = 389 | issue = 6648 | pages = 251–60 | year = 1997 | pmid = 9305837 | doi = 10.1038/38444 | bibcode = 1997Natur.389..251L }}</ref> Kemiske modifikationer af disse basiske grupper (der sidder på sidekæderne af aminosyrer) inkluderer [[methylering]], [[fosforylering]] og [[acetylering]].<ref>{{cite journal | author = Jenuwein T, Allis CD | title = Translating the histone code | journal = Science | volume = 293 | issue = 5532 | pages = 1074–80 | year = 2001 | pmid = 11498575 | doi = 10.1126/science.1063127 }}</ref> Disse kemiske modifikationer ændrer styrken af interaktionen mellem DNA'en og histonerne, hvilket gør DNA'en mere eller mindre tilgængelig for [[transskriptionsfaktor]]er og ændrer transskriptionshastigheden.<ref>{{cite journal | author = Ito T | title = Nucleosome assembly and remodelling | journal = Curr Top Microbiol Immunol | volume = 274 | pages = 1–22 | year = 2003 | pmid = 12596902 | doi = 10.1007/978-3-642-55747-7_1 | isbn = 978-3-540-44208-0 | series = Current Topics in Microbiology and Immunology }}</ref>
 
En særlig gruppe DNA-bindende proteiner er de DNA-bindende proteiner, som specifikt binder enkeltstrenget DNA. I mennesker er [[Protein A|replikationsprotein A]] det bedst kendte eksempel fra denne familie og bruges i processer, hvor dobbelthelixen er separeret, heriblandt ved DNA-replikation, rekombination og DNA-reparation.<ref>{{cite journal | author = Iftode C, Daniely Y, Borowiec JA | title = Replication protein A (RPA): the eukaryotic SSB | journal = Crit Rev Biochem Mol Biol | volume = 34 | issue = 3 | pages = 141–80 | year = 1999 | pmid = 10473346 | doi = 10.1080/10409239991209255 }}</ref> Disse bindingsproteiner lader til at stabilisere enkeltstrenget DNA og beskytte det fra at danne [[hårnålsstruktur]]er eller blive nedbrudt af [[nuklease]]r.
Linje 185:
Da disse DNA-targets kan forekomme overalt i en organismes genom, kan ændringer i en type transskriptionsfaktors aktivitet påvirke tusinder af gener.<ref>{{cite journal | author = Li Z, Van Calcar S, Qu C, Cavenee WK, Zhang MQ, Ren B | title = A global transcriptional regulatory role for c-Myc in Burkitt's lymphoma cells | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 100 | issue = 14 | pages = 8164–9 | year = 2003 | pmid = 12808131 | pmc = 166200 | doi = 10.1073/pnas.1332764100 | bibcode = 2003PNAS..100.8164L }}</ref> Som følge heraf er disse proteiner ofte mål for de [[signaltransduktion]]sprocesser, som styrer responset på miljøforandringer eller [[cellulær differentiering]] og udvikling. Specificiteten af disse transskriptionsfaktorers interaktioner med DNA kommer af, at proteinerne har flere kontakter til DNA-basernes kant, hvilket tillader dem at "læse" DNA-sekvensen. De fleste af disse baseinteraktioner sker i den store rille, hvor baserne er mest tilgængelige.<ref name="Pabo1984" />
 
=== DNA-modificerende enzymer ===
[[FileFil:EcoRV 1RVA.png|thumb|left|[[Restriktionsenzym]]et [[EcoRV]] (grøn) i et kompleks med dets substrat-DNA<ref>Skabt fra [http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1RVA PDB 1RVA]</ref>]]
==== Nukleaser og ligaser ====
[[Nuklease]]r er [[enzym]]er, som skærer DNA-strenge ved at katalysere [[hydrolyse]] af [[fosfodiester]]bindingerne. Nukleaser som hydrolyserer nukleotider fra enderne af DNA-strenge kaldes [[exonuklease]]r, mens [[endonuklease]]r skærer inde i strenge. De oftest brugte nukleaser i [[molekylærbiologi]] er [[restriktionsenzym|restriktionsendonukleaser]], som skærer DNA ved bestemte sekvenser. For eksempel genkender EcoRV-enzymet den 6-basede sekvens 5′-GATATC-3′. I naturen beskytter disse enzymer [[bakterie]]r mod [[Bakteriofag|fagfaginfektion]]infektion ved at fordøje fag-DNA'en, når den kommer ind i den bakterielle celle, og opfører sig som en del af [[restriktionsmodifikationssystem]]et.<ref>{{cite journal | author = Bickle TA, Krüger DH | title = Biology of DNA restriction | journal = Microbiol Rev | volume = 57 | issue = 2 | pages = 434–50 | year = 1993 | pmid = 8336674 | pmc = 372918 }}</ref> Inden for teknologi bruges disse sekvensspecifikke nukleaser i [[molekylær kloning]] og til at tage [[Genetisk fingeraftryk|DNA-fingeraftryk]].
 
Enzymer kaldet [[DNA-ligase]]r kan genforbinde skårede eller brækkede DNA-strenge.<ref name=Doherty>{{cite journal | author = Doherty AJ, Suh SW | title = Structural and mechanistic conservation in DNA ligases | journal = Nucleic Acids Res | volume = 28 | issue = 21 | pages = 4051–8 | year = 2000 | pmid = 11058099 | pmc = 113121 | doi = 10.1093/nar/28.21.4051 }}</ref> Ligaser er særligt vigtige i DNA-replikation af tilbagestående strenge, da de forbinder de korte DNA-segmenter, der produceres ved replikationsgaflen til en fuldstændig kopi af DNA-skabelonen. De bruges også i [[DNA-reparation]] og [[genetisk rekombination]].<ref name=Doherty/>
 
==== Topoisomeraser og helicaser ====
[[Topoisomerase]]r er enzymer med både nuklease- og ligaseaktivitet. Disse proteiner ændrer mængden af [[DNA-supercoiling|supercoiling]] i DNA. Nogle af disse enzymer fungerer ved at skære DNA-helixen og lader en sektion rotere, hvorved de reducerer mængden af supercoiling; enzymet forsegler derefter DNA-bruddet.<ref name=Champoux/> Andre typer af disse enzymer er i stand til at skære en DNA-helix og derefter sende en anden DNA-streng igennem dette brud, før det genforbinder helixen.<ref>{{cite journal | author = Schoeffler AJ, Berger JM | title = Recent advances in understanding structure-function relationships in the type II topoisomerase mechanism | journal = Biochem Soc Trans | volume = 33 | issue = Pt 6 | pages = 1465–70 | year = 2005 | pmid = 16246147 | doi = 10.1042/BST20051465 }}</ref> Topoisomeraser er nødvendige for mange processer, der involverer DNA, såsom DNA-replikation og transskription.<ref name=Wang/>
 
[[Helicase]]r er proteiner, der er en form for [[motorprotein|molekylær motor]]. De bruger den kemiske energi i [[nukleosidtrifosfat]]er, særligt [[Adenosintrifosfat|ATP]], til at bryde hydrogenbindinger mellem baser og strække DNA-dobbelthelixen ud i enkelte strenge.<ref>{{cite journal | author = Tuteja N, Tuteja R | title = Unraveling DNA helicases. Motif, structure, mechanism and function | journal = Eur J Biochem | volume = 271 | issue = 10 | pages = 1849–63 | year = 2004 | pmid = 15128295 | doi = 10.1111/j.1432-1033.2004.04094.x }}</ref> Disse enzymer er essentielle for de fleste processer hvor enzymer skal have adgang til DNA-baserne.
 
==== Polymeraser ====
[[Polymerase]]r er [[enzym]]er, der syntetiserer polynukleotidekæder fra [[nukleosidtrifosfat]]er. Deres produkters sekvens skabes på basis af eksisterende polynukleotidkæder – kaldet "skabeloner". Disse enzymer fungerer ved at føje et nukleotid til 3′-[[hydroxyl|hydroxylgruppen]]gruppen i enden af den voksende polynukleotidkæde gentagne gange. Som konsekvens heraf arbejder alle polymeraser i en 5′- til 3′-retning.<ref name=Joyce>{{cite journal | author = Joyce CM, Steitz TA | title = Polymerase structures and function: variations on a theme? | journal = J Bacteriol | volume = 177 | issue = 22 | pages = 6321–9 | year = 1995 | pmid = 7592405 | pmc = 177480 }}</ref> I disse enzymers [[aktivt sæde|aktive sæde]] baseparres den nye nukleosidtrifosfat til skabelonen: Dette lader polymeraser syntetisere deres skabelons komplementære streng på korrekt vis. Polymeraser klassificeres efter den type skabelon, som de anvender.
 
Ved DNA-replikation tager DNA-afhængige [[DNA-polymerase]]r kopier af DNA-polynukleotidkæder. For at kunne bevare biologisk information er det essentielt, at sekvensen af baser i hver kopi er præcist komplementær til sekvensen af baser i skabelonstrengen. Mange DNA-polymeraser har en korrekturlæsende aktivitet. Her genkender polymerasen den lejlighedsvise fejl i syntesereaktionen ud fra manglen på baseparring mellem de fejlmatchede nukleotider. Hvis der opdages en fejlmatch, aktiveres en 3′ til 5′ [[exonuklease]]aktivitet, og den ukorrekte base fjernes.<ref>{{cite journal | author = Hubscher U, Maga G, Spadari S | title = Eukaryotic DNA polymerases | journal = Annu Rev Biochem | volume = 71 | pages = 133–63 | year = 2002 | pmid = 12045093 | doi = 10.1146/annurev.biochem.71.090501.150041 }}</ref> I de fleste organismer fungerer DNA-polymeraser i et stort kompleks kaldet [[replisom]]et, der indeholder flere tilhørende underenheder, såsom [[DNA-klemme]]n eller [[helicase]]rne.<ref>{{cite journal | author = Johnson A, O'Donnell M | title = Cellular DNA replicases: components and dynamics at the replication fork | journal = Annu Rev Biochem | volume = 74 | pages = 283–315 | year = 2005 | pmid = 15952889 | doi = 10.1146/annurev.biochem.73.011303.073859 }}</ref>
Linje 206:
Transskription udføres af en DNA-afhængig [[RNA-polymerase]], der kopierer en DNA-strengs sekvens ind i RNA. For at påbegynde transskriptionen af et gen binder RNA-polymerasen til en DNA-sekvens kaldet en [[Promoter (biologi)|promoter]] og separerer DNA-strengene. Derefter kopierer den gensekvensen ind i en [[messenger RNA]]-udskrift, indtil den når en DNA-region kaldet [[terminator (genetik)|terminatoren]], hvor den stopper og afkobles fra DNA'en. Ligesom det er tilfældet med menneskelige DNA-afhængige DNA-polymeraser, opererer [[RNA polymerase II]], det enzym, der transskriberer de fleste af generne i det menneskelige genom, som en del af et stort [[proteinkompleks]] med flere regulerende og tilhørende underenheder.<ref>{{cite journal | author = Martinez E | title = Multi-protein complexes in eukaryotic gene transcription | journal = Plant Mol Biol | volume = 50 | issue = 6 | pages = 925–47 | year = 2002 | pmid = 12516863 | doi = 10.1023/A:1021258713850 }}</ref>
 
== Genetisk rekombination ==
{{uddybende|Genetisk rekombination}}
<div class="thumb tright" style="background:#f9f9f9; border:1px solid #ccc; margin:0.5em;">
{| border="0" border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:250px; font-size:85%; border:1px solid #ccc; margin:0.3em;"
|-
|[[FileFil:Holliday Junction.svg|250px]]
|-
|[[FileFil:Holliday junction coloured.png|250px]]
|}
<div style="border: none; width:250px;"><div class="thumbcaption">[[Hollidaykors]]ets struktur i [[genetisk rekombination]]. De fire separate DNA-strenge er farvet rød, blå, grøn og gul.<ref>Skabt fra [http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1M6G PDB 1M6G]</ref></div></div></div>
[[FileFil:Chromosomal Recombination.svg|thumb|250px|left|Rekombination involverer brydningen og genforeningen af to kromosomer (M og F) for at producere to omarrangerede kromosomer (C1 og C2).]]
 
En DNA-helix interagerer normalt ikke med andre DNA-segmenter, og i menneskeceller er de forskellige kromosomer oven i købet placeret i separate områder i cellekernen kaldet "[[kromosomterritorie]]r".<ref>{{cite journal | author = Cremer T, Cremer C | title = Chromosome territories, nuclear architecture and gene regulation in mammalian cells | journal = Nature Reviews Genetics | volume = 2 | issue = 4 | pages = 292–301 | year = 2001 | pmid = 11283701 | doi = 10.1038/35066075 }}</ref> Denne fysiske adskillelse af forskellige kromosomer er vigtig for DNA'ens evne til at fungere som et stabilt informationsarkiv, da en af de få gange kromosomer interagerer er ved [[overkrydsning]], der sker under [[kønnet formering]], hvor [[genetisk rekombination]] finder sted. "Overkrydsning" betegner når to DNA-helixer brydes op, udveksler en sektion og derefter genforenes.
Linje 224:
Den mest almindelige form for overkrydsning er [[homolog rekombination]], hvor de to involverede kromosomer deler meget ens sekvenser. Ikke-homolog rekombination kan være skadelig for celler, da det kan producere [[translokation|kromosomale translokationer]] og genetiske abnormiteter. Rekombinationsreaktionen katalyseres af enzymer kendt som [[rekombinase]]r, såsom [[RAD51]].<ref>{{cite journal | author = Vispé S, Defais M | title = Mammalian Rad51 protein: a RecA homologue with pleiotropic functions | journal = Biochimie | volume = 79 | issue = 9–10 | pages = 587–92 | year = 1997 | pmid = 9466696 | doi = 10.1016/S0300-9084(97)82007-X }}</ref> Det første skridt ved rekombination er et dobbeltstrenget brud forårsaget af enten en [[endonuklease]] eller beskadigelse af DNA'en.<ref>{{cite journal | author = Neale MJ, Keeney S | title = Clarifying the mechanics of DNA strand exchange in meiotic recombination | journal = Nature | volume = 442 | issue = 7099 | pages = 153–8 | year = 2006 | pmid = 16838012 | doi = 10.1038/nature04885 | bibcode = 2006Natur.442..153N }}</ref> En række skridt delvist katalyseret af rekombinasen fører derefter til sammenføjningen af de to helixer ved mindst et [[Hollidaykors]], hvori et segment af en enkelt streng i hver helix knyttes til den komplementære streng i den anden helix. Hollidaykorset er en [[Tetraeder|tetraedrisk]] knudepunktsstruktur, der kan flyttes langs kromosomparret, og udskifter en streng med en anden. Rekombinationsreaktionen stoppes derefter af spaltning af knudepunktet og re-ligeringen af det frigivne DNA.<ref>{{cite journal | author = Dickman MJ, Ingleston SM, Sedelnikova SE, Rafferty JB, Lloyd RG, Grasby JA, Hornby DP | title = The RuvABC resolvasome | journal = Eur J Biochem | volume = 269 | issue = 22 | pages = 5492–501 | year = 2002 | pmid = 12423347 | doi = 10.1046/j.1432-1033.2002.03250.x }}</ref>
 
== Evolution ==
{{uddybende|RNA-verdenshypotesen}}
DNA indeholder den genetiske information, der lader alle moderne levende ting fungere, vokse og reproducere. Det er dog uklart, hvor langt tilbage i livets fire milliarder år lange historie DNA har haft denne funktion, og det har været foreslået at de tidligste livsformer kan have anvendt RNA som deres genetiske materiale.<ref name=autogenerated1>{{cite journal | author = Joyce GF | title = The antiquity of RNA-based evolution | journal = Nature | volume = 418 | issue = 6894 | pages = 214–21 | year = 2002 | pmid = 12110897 | doi = 10.1038/418214a | bibcode = 2002Natur.418..214J }}</ref><ref>{{cite journal | author = Orgel LE | title = Prebiotic chemistry and the origin of the RNA world | journal = Crit Rev Biochem Mol Biol | volume = 39 | issue = 2 | pages = 99–123 | year = 2004 | pmid = 15217990 | doi = 10.1080/10409230490460765 }}</ref> RNA kan have opført sig som den centrale del af tidlig [[stofskifte|cellemetabolisme]], da det både kan transmittere genetisk information og udføre [[katalyse]] som en del af [[ribozym]]er.<ref>{{cite journal | author = Davenport RJ | title = Ribozymes. Making copies in the RNA world | journal = Science | volume = 292 | issue = 5520 | page = 1278 | year = 2001 | pmid = 11360970 | doi = 10.1126/science.292.5520.1278a }}</ref> Denne urgamle [[RNA-verdenshypotesen|RNA-verden]], hvor nukleinsyrer i så fald blev brugt til både katalyse og genetik, kan have påvirket [[evolution|udviklingudviklingen]]en af den nuværende genetiske kode baseret på fire nukleotidbaser. Dette ville ske fordi antallet af forskellige baser i en sådanne organisme er en afvejning mellem et lille antal baser med bedre replikationspræcision og et stort antal baser med bedre katalytisk ribozymeffektivitet.<ref>{{cite journal | author = Szathmáry E | title = What is the optimum size for the genetic alphabet? | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 89 | issue = 7 | pages = 2614–8 | year = 1992 | pmid = 1372984 | pmc = 48712 | doi = 10.1073/pnas.89.7.2614 | bibcode = 1992PNAS...89.2614S }}</ref> Der er dog ingen direkte beviser på urgamle genetiske systemer, da det er umuligt at isolere DNA fra de fleste fossiler, idet DNA kun overlever i miljøet i mindre end en million år og langsomt nedbrydes til korte fragmenter i opløsning.<ref>{{cite journal | author = Lindahl T | title = Instability and decay of the primary structure of DNA | journal = Nature | volume = 362 | issue = 6422 | pages = 709–15 | year = 1993 | pmid = 8469282 | doi = 10.1038/362709a0 | bibcode = 1993Natur.362..709L }}</ref> Der er blevet fremsat påstande om ældre DNA; bedst kendt er en rapport om isoleringen af en levedygtig bakterie fra en 250 millioner år gammel saltkrystal,<ref>{{cite journal | author = Vreeland RH, Rosenzweig WD, Powers DW | title = Isolation of a 250 million-year-old halotolerant bacterium from a primary salt crystal | journal = Nature | volume = 407 | issue = 6806 | pages = 897–900 | year = 2000 | pmid = 11057666 | doi = 10.1038/35038060 }}</ref> men disse påstande er kontroversielle.<ref>{{cite journal | author = Hebsgaard MB, Phillips MJ, Willerslev E | title = Geologically ancient DNA: fact or artefact? | journal = Trends Microbiol | volume = 13 | issue = 5 | pages = 212–20 | year = 2005 | pmid = 15866038 | doi = 10.1016/j.tim.2005.03.010 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Nickle DC, Learn GH, Rain MW, Mullins JI, Mittler JE | title = Curiously modern DNA for a "250 million-year-old" bacterium | journal = J Mol Evol | volume = 54 | issue = 1 | pages = 134–7 | year = 2002 | pmid = 11734907 | doi = 10.1007/s00239-001-0025-x }}</ref>
 
DNA-byggesten ([[adenin]], [[guanin]] og relaterede [[organisk forbindelse|organiske forbindelser]]) kan være blevet dannet uden for Jordens atmosfære, i det [[ydre rum]].<ref name="Callahan">{{cite journal | author = Callahan MP, Smith KE, Cleaves HJ, Ruzicka J, Stern JC, Glavin DP, House CH, Dworkin JP | title = Carbonaceous meteorites contain a wide range of extraterrestrial nucleobases | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. | volume = 108 | issue = 34 | pages = 13995–8 |date=August 2011 | pmid = 21836052 | pmc = 3161613 | doi = 10.1073/pnas.1106493108 | url = |bibcode = 2011PNAS..10813995C }}</ref><ref name="Steigerwald">{{cite web |last=Steigerwald |first=John |title=NASA Researchers: DNA Building Blocks Can Be Made in Space|url=http://www.nasa.gov/topics/solarsystem/features/dna-meteorites.html|publisher=[[NASA]] |date=8. august 2011 |accessdate=10. august 2011}}</ref><ref name="DNA">{{cite web |author=ScienceDaily Staff |title=DNA Building Blocks Can Be Made in Space, NASA Evidence Suggests|url=http://www.sciencedaily.com/releases/2011/08/110808220659.htm |date=9. august 2011 |publisher=[[ScienceDaily]] |accessdate=9. august 2011}}</ref> Komplekse DNA- og RNA-[[organisk forbindelse|forbindelser]], heriblandt [[uracil]], [[cytosin]] og [[thymin]], er også blevet dannet i laboratorier under forhold der efterligner dem, der findes i det ydre rum, ved brug af udgangsstoffer (såsom [[pyrimidin]]) fundet i [[meteorit]]ter. Pyrimidin kan, ligesom [[Aromatiske kulbrinter|polycykliske aromatiske hydrocarboner]] (PAH'er), de mest carbon-rige kemiske forbindelser i [[universet]], være blevet dannet i [[rød kæmpe|røde kæmper]] eller i [[kosmisk støv]] og gasskyer.<ref name="NASA-20150303">{{cite web |last=Marlaire |first=Ruth |title=NASA Ames Reproduces the Building Blocks of Life in Laboratory |url=http://www.nasa.gov/content/nasa-ames-reproduces-the-building-blocks-of-life-in-laboratory |date=3. marts 2015 |work=[[NASA]] |accessdate=5. marts 2015 }}</ref>
 
== Anvendelse inden for teknologi ==
=== Genteknologi ===
{{uddybende|Molekylærbiologi|genteknologi}}
[[FileFil: DNA DL90 (geograph 2847164).jpg|thumb|right|En DNA-skulptur lavet af indkøbsvogne]]
Der er blevet udviklet metoder til at oprense DNA fra organismer, såsom [[fenol-kloroformudvinding]], og til at manipulere det i laboratorier, såsom [[restriktionsfordøjelse]]r og [[polymerasekædereaktion]]. Moderne [[biologi]] og [[biokemi]] gør intensivt brug af disse teknikker i rekombinant DNA-teknologi. [[Rekombinant DNA]] er menneskeskabte DNA-sekvenser, der er blevet samlet fra andre DNA-sekvenser. De kan [[transformation (genetik)|transformeres]] til organismer i form af [[plasmid]]er eller i passende format ved brug af en [[viral vektor]].<ref>{{cite journal | author = Goff SP, Berg P | title = Construction of hybrid viruses containing SV40 and lambda phage DNA segments and their propagation in cultured monkey cells | journal = Cell | volume = 9 | issue = 4 PT 2 | pages = 695–705 | year = 1976 | pmid = 189942 | doi = 10.1016/0092-8674(76)90133-1 }}</ref> [[Genteknologi|Genetisk modificerede]] organismer kan bruges til at producere produkter såsom rekombinante [[protein]]er, til brug i biomedicinsk forskning,<ref>{{cite journal | author = Houdebine LM | title = Transgenic animal models in biomedical research | journal = Methods Mol Biol | volume = 360 | pages = 163–202 | year = 2007 | pmid = 17172731 | doi = 10.1385/1-59745-165-7:163 | isbn = 1-59745-165-7 }}</ref> eller dyrkes i [[landbrug]]et.<ref>{{cite journal | author = Daniell H, Dhingra A | title = Multigene engineering: dawn of an exciting new era in biotechnology | journal = Current Opinion in Biotechnology | volume = 13 | issue = 2 | pages = 136–41 | year = 2002 | pmid = 11950565 | pmc = 3481857 | doi = 10.1016/S0958-1669(02)00297-5 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Job D | title = Plant biotechnology in agriculture | journal = Biochimie | volume = 84 | issue = 11 | pages = 1105–10 | year = 2002 | pmid = 12595138 | doi = 10.1016/S0300-9084(02)00013-5 }}</ref>
 
=== DNA-profil ===
{{uddybende|DNA-profil}}
[[Kriminalteknik|Kriminalteknikere]]ere kan bruge DNA i [[blod]], [[sæd]], [[hud]], [[spyt]] eller [[hår]] fundet på et [[gerningssted]] til at identificere matchende DNA fra et individ, såsom en gerningsmand. Denne proces kendes formelt som etablering af en [[DNA-profil]], men kan også kaldes "[[genetisk fingeraftryk|genetiske fingeraftryk]]". I DNA-profiler sammenlignes længderne på variable sektioner af repetitiv DNA, såsom [[mikrosatellit]]ter, mellem to mennesker. Denne metode er normalt en ekstremt troværdig teknik til at identificere matchende DNA.<ref>{{cite journal | author = Collins A, Morton NE | title = Likelihood ratios for DNA identification | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 91 | issue = 13 | pages = 6007–11 | year = 1994 | pmid = 8016106 | pmc = 44126 | doi = 10.1073/pnas.91.13.6007 | bibcode = 1994PNAS...91.6007C }}</ref> Identifikation kan dog være kompliceret, hvis stedet er forurenet med DNA fra flere mennesker.<ref>{{cite journal | author = Weir BS, Triggs CM, Starling L, Stowell LI, Walsh KA, Buckleton J | title = Interpreting DNA mixtures | journal = J Forensic Sci | volume = 42 | issue = 2 | pages = 213–22 | year = 1997 | pmid = 9068179 }}</ref> DNA-profiler blev udviklet i 1984 af den britiske genetiker Sir [[Alec Jeffreys]]<ref>{{cite journal | author = Jeffreys AJ, Wilson V, Thein SL | title = Individual-specific 'fingerprints' of human DNA | journal = Nature | volume = 316 | issue = 6023 | pages = 76–9 | year = 1985 | pmid = 2989708 | doi = 10.1038/316076a0 | bibcode = 1985Natur.316...76J }}</ref> og brugt første gang inden for kriminalteknik til at dømme Colin Pitchfork i [[Colin Pitchfork|Enderby-mordene]] i 1988.<ref>[https://web.archive.org/web/20061214004903/http://www.forensic.gov.uk/forensic_t/inside/news/list_casefiles.php?case=1 Colin Pitchfork&nbsp;— first murder conviction on DNA evidence also clears the prime suspect] Forensic Science Service Accessed 23 December 2006</ref>
 
Udviklingen af kriminalteknik, og evnen til nu at fremskaffe genetisk match på små prøver af blod, hud, spyt eller hår, har ført til en genundersøgelse af en række sager. Mennesker, der er anklaget for en alvorlig forbrydelse, kan blive afkrævet en DNA-prøve til sammenligning. I [[Danmark]] har et af de mest notable eksempler på en sag, hvor DNA-profil var af afgørende betydning, været ved efterforskningen af de drab og voldtægter, der blev begået af [[Marcel Lychau Hansen]], bedre kendt som "Amagermanden"<ref>{{Kilde nyheder
Linje 250:
DNA-profiler bruges også til [[faderskabstest]]s for at afgøre, hvorvidt en person er biologisk forælder eller bedsteforælder til et barn med en sandsynlighedsgrad på 99,99% for, hvorvidt den angivelige forælder er biologisk beslægtet med barnet. Normale DNA-sekventeringsmetoder sker efter fødslen, men der findes nye metoder, hvorved man kan teste for faderskab mens moderen stadig er gravid.<ref>[http://www.nytimes.com/2012/06/20/health/paternity-blood-tests-that-work-early-in-a-pregnancy.html?pagewanted=all "Paternity Blood Tests That Work Early in a Pregnancy" New York Times June 20, 2012]</ref>
 
=== DNA-enzymer eller katalytisk DNA ===
{{uddybende|Deoxyribozym}}
[[Deoxyribozym]]er, også kaldet DNAzymer eller katalytisk DNA, blev opdaget i 1994.<ref name="Breaker 223–229">{{Cite journal|title = A DNA enzyme that cleaves RNA|url = http://www.cell.com/article/1074552194900140/abstract|journal = Chemistry & Biology|date = 1994-01-12|issn = 1074-5521|pmid = 9383394|pages = 223–229|volume = 1|issue = 4|doi = 10.1016/1074-5521(94)90014-0|first = Ronald R.|last = Breaker|first2 = Gerald F.|last2 = Joyce}}</ref> Det er for det meste enkeltstrengede DNA-sekvenser, der er isoleret fra en stor pulje af tilfældige DNA-sekvenser gennem en kombineret tilgang kaldet ''in vitro''-selektion eller [[SELEX]]. DNAzymer katalyserer en række kemiske reaktioner, heriblandt RNA/DNA-spaltning, RNA/DNA-ligering, aminosyrefosforylering/defosforylering, o.a. DNAzymer kan øge hastigheden af kemiske reaktioner op til 100.000.000.000 gange hastigheden af den ukatalyserede reaktion.<ref>{{Cite journal|title = DNA-catalyzed sequence-specific hydrolysis of DNA|url = http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nchembio.201|journal = Nature Chemical Biology|pmc = 2746877|pmid = 19684594|pages = 718–720|volume = 5|issue = 10|doi = 10.1038/nchembio.201|first = Madhavaiah|last = Chandra|first2 = Amit|last2 = Sachdeva|first3 = Scott K|last3 = Silverman}}</ref> Den mest studerede klasse af DNAzymer er RNA-spaltende DNAzymer, som er blevet brugt til opdagelse af forskellige metalioner og til at designe terapeutiske midler. Der er fundet flere metalspecifikke DNAzymer, heriblandt GR-5-DNAzymet ([[bly]]-specifikt),<ref name="Breaker 223–229"/> CA1-3-DNAzymet ([[kobber]]-specifikt),<ref>{{Cite journal|title = In vitro selection of self-cleaving DNAs|url = http://www.cell.com/article/S1074552196901702/abstract|journal = Chemistry & Biology|date = 1996-01-12|issn = 1074-5521|pmid = 9000012|pages = 1039–1046|volume = 3|issue = 12|doi = 10.1016/S1074-5521(96)90170-2|first = Nir|last = Carmi|first2 = Lisa A.|last2 = Shultz|first3 = Ronald R.|last3 = Breaker}}</ref> 39E-DNAzymet ([[uranyl]]-specifikt) og NaA43-DNAzymet ([[natrium]]-specifikt).<ref>{{Cite journal|title = In vitro selection of a sodium-specific DNAzyme and its application in intracellular sensing|url = http://www.pnas.org/content/112/19/5903|journal = Proceedings of the National Academy of Sciences|date = 2015-05-12|issn = 0027-8424|pmc = 4434688|pmid = 25918425|pages = 5903–5908|volume = 112|issue = 19|doi = 10.1073/pnas.1420361112|first = Seyed-Fakhreddin|last = Torabi|first2 = Peiwen|last2 = Wu|first3 = Claire E.|last3 = McGhee|first4 = Lu|last4 = Chen|first5 = Kevin|last5 = Hwang|first6 = Nan|last6 = Zheng|first7 = Jianjun|last7 = Cheng|first8 = Yi|last8 = Lu}}</ref>
 
=== Bioinformatik ===
{{uddybende|Bioinformatik}}
[[Bioinformatik]] involverer udviklingen af teknikker til at opbevare, [[data mining|data mine]], søge i og manipulere biologiske data, heriblandt [[DNA-sekvens]]data. Dette har ført til vidt anvendte fremskridt inden for [[datalogi]], særligt [[string-searching-algoritme]]r, [[maskinelæring]] og [[databaseteori]].<ref>{{Cite book | last1=Baldi|first1= Pierre|author1-link=Pierre Baldi|last2= Brunak|first2= Soren | title=Bioinformatics: The Machine Learning Approach | publisher= MIT Press | year=2001| isbn=978-0-262-02506-5 | oclc=45951728}}</ref> String-searching eller matchingalgoritmer, som genkender en bogstavsekvens inde i en større sekvens af bogstaver, blev udviklet til at søge efter bestemte nukleotidsekvenser.<ref>Gusfield, Dan. ''Algorithms on Strings, Trees, and Sequences: Computer Science and Computational Biology''. [[Cambridge University Press]], 15 January 1997. ISBN 978-0-521-58519-4.</ref> DNA-sekvensen bliver [[sekvenssammenstilling|sammenstillet]] med andre DNA-sekvenser for at identificere [[homologi (biologi)|homologe]] sekvenser og lokalisere de specifikke [[mutation]]er, der gør dem specielle. Disse teknikker, særligt [[multiple sammenstillinger|multiple sekvenssammenstillinger]], bruges til at studere [[fylogenetik|fylogenetiske]] forhold og proteinfunktioner.<ref>{{cite journal | author = Sjölander K | title = Phylogenomic inference of protein molecular function: advances and challenges | journal = Bioinformatics | volume = 20 | issue = 2 | pages = 170–9 | year = 2004 | pmid = 14734307 | doi = 10.1093/bioinformatics/bth021 }}</ref> Datasæt, der repræsenterer hele genomers DNA-sekvenser, såsom de der er produceret af [[Human Genome Project]], er svære at bruge uden de annoteringer, der identificerer generne og de regulerende elementers beliggenhed på hvert kromosom. DNA-sekvensregioner, der har de karakteristiske mønstre, som associeres med protein- eller RNA-kodende gener, kan identificeres ved [[Genforudsigelse|genfindende]] algoritmer, som tillader forskere at forudsige tilstedeværelsen af bestemte [[genprodukt]]er og deres mulige funktioner i en organisme, selv før de er blevet isoleret eksperimentelt.<ref name="Mount">{{cite book|author = Mount DM |title=Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis | edition = 2 | publisher = Cold Spring Harbor Laboratory Press | year = 2004 | isbn = 0-87969-712-1|oclc = 55106399|location=Cold Spring Harbor, NY}}</ref> Hele genomer kan også sammenlignes, hvilket kan skabe klarhed omkring en bestemt organismes evolutionære historie og tillade undersøgelsen af komplekse evolutionære begivenheder.
 
=== DNA-nanoteknologi ===
{{uddybende|DNA-nanoteknologi}}
[[FileFil:DNA nanostructures.png|thumb|DNA-strukturen vist skematisk til venstre vil samle sig selv til strukturen visualiseret ved [[atomart kraftmikroskop|atomar kraftmikroskopi]] til højre. [[DNA-nanoteknologi]] er det felt, der søger at designe strukturer på nanoskala ved brug af DNA-molekylers [[molekylær genkendelse|molekylære genkendelsesegenskaber]]. Billede fra {{doi-inline|10.1371/journal.pbio.0020073|Strong, 2004}}.]]
 
DNA-nanoteknologi anvender DNA's og andre nukleinsyrers unikke [[molekylær genkendelse|molekylære genkendelsesegenskaber]] til at skabe selvsamlende forgrenede DNA-komplekser med nyttige egenskaber.<ref>{{cite journal | author = Rothemund PW | title = Folding DNA to create nanoscale shapes and patterns | journal = Nature | volume = 440 | issue = 7082 | pages = 297–302 | year = 2006 | pmid = 16541064 | doi = 10.1038/nature04586 | bibcode = 2006Natur.440..297R }}</ref> DNA bruges således som et strukturelt materiale snarere end som en bærer af biologisk information. Dette har ført til skabelsen af to-dimensionelle periodiske gitre (der begge er flise-baserede og anvender "[[DNA-origami]]"-metoden) såvel som tredimensionelle strukturer i form af [[Polyeder|polyedre]].<ref>{{cite journal | author = Andersen ES, Dong M, Nielsen MM, Jahn K, Subramani R, Mamdouh W, Golas MM, Sander B, Stark H, Oliveira CL, Pedersen JS, Birkedal V, Besenbacher F, Gothelf KV, Kjems J | title = Self-assembly of a nanoscale DNA box with a controllable lid | journal = Nature | volume = 459 | issue = 7243 | pages = 73–6 | year = 2009 | pmid = 19424153 | doi = 10.1038/nature07971 | bibcode = 2009Natur.459...73A }}</ref> [[DNA-maskine|Nanomekaniske enheder]] og [[DNA-computer|algoritmisk selv-samling]] er også blevet demonstreret,<ref>{{cite journal | author = Ishitsuka Y, Ha T | title = DNA nanotechnology: a nanomachine goes live | journal = Nat Nanotechnol | volume = 4 | issue = 5 | pages = 281–2 | year = 2009 | pmid = 19421208 | doi = 10.1038/nnano.2009.101 | bibcode = 2009NatNa...4..281I }}</ref> og disse DNA-strukturer er blevet anvendt som skabeloner for arrangeringen af andre molekyler såsom [[kolloidalt guld|guldnanopartikler]] og [[streptavidin]]-proteiner.<ref>{{cite journal | author = Aldaye FA, Palmer AL, Sleiman HF | title = Assembling materials with DNA as the guide | journal = Science | volume = 321 | issue = 5897 | pages = 1795–9 | year = 2008 | pmid = 18818351 | doi = 10.1126/science.1154533 | bibcode = 2008Sci...321.1795A }}</ref>
 
=== Historie og antropologi ===
{{uddybende|Fylogenetik|Genetisk genealogi}}
Fordi DNA undergår mutationer over tid, som derefter nedarves, indeholder det historisk information, og ved at sammenligne DNA-sekvenser kan genetikere udlede organismers evolutionære historie, deres [[Fylogenetik|fylogeni]].<ref>{{cite journal | author = Wray GA | title = Dating branches on the Tree of Life using DNA | journal = Genome Biol | volume = 3 | issue = 1 | pages = reviews0001.1–reviews0001.7 | year = 2002 | pmid = 11806830 | pmc = 150454 | doi = 10.1046/j.1525-142X.1999.99010.x | nopp = true }}</ref> Feltet fylogenetik er et vigtigt værktøj inden for [[evolutionsbiologi]]. Hvis der sammenlignes DNA-sekvenser inden for samme art, kan [[populationsgenetik]]ere lære om en bestemt populations historie. Dette kan bruges i studier af alt fra [[økologisk genetik]] til [[antropologi]]; for eksempel benyttes DNA-beviser til at forsøge at identificere [[Israels ti forsvundne stammer]].<ref>''Lost Tribes of Israel'', [[Nova (TV series)|NOVA]], PBS airdate: 22 February 2000. Transcript available from [http://www.pbs.org/wgbh/nova/transcripts/2706israel.html PBS.org]. Retrieved 4 March 2006.</ref><ref>Kleiman, Yaakov. [http://www.aish.com/societywork/sciencenature/the_cohanim_-_dna_connection.asp "The Cohanim/DNA Connection: The fascinating story of how DNA studies confirm an ancient biblical tradition".] ''aish.com'' (13 January 2000). Retrieved 4 March 2006.</ref>
 
=== Informationslagring ===
I en rapport udgivet i ''[[Nature (tidsskrift)|Nature]]'' i januar 2013 foreslog forskere fra [[European Bioinformatics Institute]] og [[Agilent Technologies]] en mekanisme til at benytte DNA's evne til at kode information som en måde at lagre digitale data. Gruppen var i stand til at kode 739 kilobyte data ind i DNA-kode, syntetisere den faktiske DNA og derefter sekventere DNA'en og afkode informationen tilbage til dens oprindelige form, med 100% nøjagtighed. Den kodede information bestod af tekst- og lydfiler. Et tidligere eksperiment blev udgivet i august 2012, udført af forskere ved [[Harvard University]], hvor man kodede teksten til en 54.000 ord lang bog ind i DNA.<ref>{{cite journal | author = Goldman N, Bertone P, Chen S, Dessimoz C, LeProust EM, Sipos B, Birney E | title = Towards practical, high-capacity, low-maintenance information storage in synthesized DNA | journal = Nature | volume = 494 | issue = 7435 | pages = 77–80 | date = 23. januar 2013 | pmid = 23354052 | pmc = 3672958 | doi = 10.1038/nature11875 | bibcode = 2013Natur.494...77G }}</ref><ref>{{Kilde nyheder|last=Naik|first=Gautam|title=Storing Digital Data in DNA|url=http://online.wsj.com/article/SB10001424127887324539304578259883507543150.html|accessdate=24. januar 2013|newspaper=[[Wall Street Journal]]|date=24. januar 2013}}</ref>
 
[[FileFil:Maclyn McCarty with Francis Crick and James D Watson - 10.1371 journal.pbio.0030341.g001-O.jpg|thumb|[[James Watson]] og [[Francis Crick]] (højre), ophavsmændene til dobbelthelix-modellen, med Maclyn McCarty (venstre).]]
[[FileFil:Pencil sketch of the DNA double helix by Francis Crick Wellcome L0051225.jpg|thumb|right|Blyantskladde af DNA-dobbelthelixen af Francis Crick i 1953]]
== DNA-forskningens historie ==
DNA blev identificeret og isoleret for første gang af den schweiziske læge [[Friedrich Miescher]], som i 1869 opdagede en mikroskopisk substans i materie fra kasserede kirurgibandager. Da det var placeret i cellernes kerner ([[latin]]: ''nukleus'', [[Pluralis|flertal]] ''nuklei'') kaldte han det "nuklein".<ref>Miescher, Friedrich (1871) [https://books.google.com/books?id=YJRTAAAAcAAJ&pg=PA441#v=onepage&q&f=false "Ueber die chemische Zusammensetzung der Eiterzellen"], ''Medicinisch-chemische Untersuchungen'', '''4''' : 441–460. [https://books.google.com/books?id=YJRTAAAAcAAJ&pg=PA456#v=onepage&q&f=false Fra p. 456:] ''"Ich habe mich daher später mit meinen Versuchen an die ganzen Kerne gehalten, die Trennung der Körper, die ich einstweilen ohne weiteres Präjudiz als lösliches und unlösliches Nuclein bezeichnen will, einem günstigeren Material überlassend."''</ref><ref>{{cite journal | author = Dahm R | title = Discovering DNA: Friedrich Miescher and the early years of nucleic acid research | journal = Hum. Genet. | volume = 122 | issue = 6 | pages = 565–81 | year = 2008 | pmid = 17901982 | doi = 10.1007/s00439-007-0433-0 }}</ref>
 
I 1878 isolerede [[Albrecht Kossel]] ikke-protein-komponenten af "nuklein", nukleinsyre, og isolerede senere dets fem primære [[nukleobase]]r.<ref>Se:
* Albrect Kossel (1879) [http://books.google.co.cr/books?id=4H5NAAAAYAAJ&pg=PA284#v=onepage&q&f=false "Ueber Nucleïn der Hefe"] ''Zeitschrift für physiologische Chemie'', '''3''' : 284-291.
* Albrect Kossel (1880) [http://books.google.co.cr/books?id=u4s1AQAAMAAJ&pg=PA290#v=onepage&q&f=false "Ueber Nucleïn der Hefe II"] ''Zeitschrift für physiologische Chemie'', '''4''' : 290-295.
* Albrect Kossel (1881) [http://books.google.co.cr/books?id=xYs1AQAAMAAJ&pg=PA267#v=onepage&q&f=false "Ueber die Verbreitung des Hypoxanthins im Thier- und Pflanzenreich"] ''Zeitschrift für physiologische Chemie'', '''5''' : 267-271.
* Albrect Kossel, ''Untersuchungen über die Nucleine und ihre Spaltungsprodukte'' (Strassburg, Germany: K.J. Trübne, 1881), 19 pages.
* Albrect Kossel (1882) [http://books.google.co.cr/books?id=z4s1AQAAMAAJ&pg=PA422#v=onepage&q&f=false "Ueber Xanthin und Hypoxanthin"], ''Zeitschrift für physiologische Chemie'', '''6''' : 422-431.
* Albrect Kossel (1883) [http://books.google.co.cr/books?id=2os1AQAAMAAJ&pg=PA7#v=onepage&q&f=false "Zur Chemie des Zellkerns"], ''Zeitschrift für physiologische Chemie'', '''7''' : 7-22.
* Albrect Kossel (1886) "Weitere Beiträge zur Chemie des Zellkerns", ''Zeitschrift für Physiologische Chemie'', '''10''' : 248-264. Tilgængelig online på: [http://vlp.mpiwg-berlin.mpg.de/library/data/lit16615/index_html?pn=1&ws=1.5 Max Planck Institute for the History of Science, Berlin, Germany]. på p. 264 bemærker Kossel: ''"Der Erforschung der quantitativen Verhältnisse der vier stickstoffreichen Basen, der Abhängigkeit ihrer Menge von den physiologischen Zuständen der Zelle, verspricht wichtige Aufschlüsse über die elementaren physiologisch-chemischen Vorgänge."'' </ref><ref name="Yale_Jones_1953">{{cite journal | author = Jones ME | title = Albrecht Kossel, A Biographical Sketch | journal = Yale Journal of Biology and Medicine | volume = 26 | issue = 1 | pages = 80–97 | year = September 1953 | pmid = 13103145 | pmc = 2599350 | publisher = [[National Center for Biotechnology Information]] }}</ref> I 1919 identificerede Phoebus Levene de grundlæggende sukker- og fosfat-nukleotidenheder.<ref>{{cite journal |author=Levene P, |title=The structure of yeast nucleic acid| journal=J Biol Chem |volume=40 |issue=2 | pages=415–24 |date=1. december 1919}}</ref> Levene foreslog, at DNA bestod af en streng af nukleotidenheder, der er forbundet via fosfatgrupperne. Levene troede, at kæden var kort, og at baserne blev gentaget i en fast rækkefølge. I 1937 producerede [[William Astbury]] de første røntgendiffraktionsmønstre, der viste, at DNA har en regelmæssig struktur.<ref>See:
* W. T. Astbury and Florence O. Bell (1938) "Some recent developments in the X-ray study of proteins and related structures," ''Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology'', '''6''' : 109-121. Available on-line at: [http://www.leeds.ac.uk/heritage/Astbury/bibliography/CSHSQB_Astbury_and_Bell_1938.pdf University of Leeds.]
* Astbury, W. T., (1947) "X-ray studies of nucleic acids," ''Symposia of the Society for Experimental Biology'', '''1''' : 66-76. Available on-line at: [http://scarc.library.oregonstate.edu/coll/pauling/dna/papers/astbury-xray.html Oregon State University.]</ref>
 
I 1927 foreslog [[Nikolai Koltsov]], at nedarvede egenskaber blev nedarvet gennem et "enormt arveligt molekyle" bestående af "to spejlede strenge, der ville replikere på en semi-konservativ måde ved at bruge hver streng som en skabelon".<ref>Koltsov foreslog, at en celles genetiske information blev kodet i en lang kæde af aminosyrer. Se:
* Н. К. Кольцов, "Физико-химические основы морфологии" (The physical-chemical basis of morphology) -- speech given at the 3rd All-Union Meeting of Zoologist, Anatomists, and Histologists at Leningrad, U.S.S.R., December 12, 1927.
* Genoptrykt i: ''Успехи экспериментальной биологии'' (Advances in Experimental Biology), series B, 7 (1) : ?-? (1928).
* Genoptrykt på tysk som: Nikolaj K. Koltzoff (1928) "Physikalisch-chemische Grundlagen der Morphologie", ''Biologisches Zentralblatt'', '''48''' (6) : 345-369.
* I 1934 argumenterede Koltsov for, at proteinerne, der indeholder en celles genetiske information, undergik replikation. Se: N. K. Koltzoff (October 5, 1934) "The structure of the chromosomes in the salivary glands of Drosophila," ''Science'', '''80''' (2075) : 312-313. Citat side 313: "I think that the size of the chromosomes in the salivary glands [of Drosophila] is determined through the multiplication of ''genonemes''. By this term I designate the axial thread of the chromosome, in which the geneticists locate the linear combination of genes; … In the normal chromosome there is usually only one genoneme; before cell-division this genoneme has become divided into two strands."</ref><ref name="Soyfer">{{cite journal | author = Soyfer VN | title = The consequences of political dictatorship for Russian science | journal = Nature Reviews Genetics | volume = 2 | issue = 9 | pages = 723–729 | year = 2001 | pmid = 11533721 | doi = 10.1038/35088598 }}</ref> I 1928 opdagede [[Frederick Griffith]] i sit [[Griffith's eksperiment|eksperiment]], at [[fænotype|træk]] fra den "glatte" form for ''Pneumococcus'' kunne overføres til den "ru" form af den samme bakterie ved at blande dræbte "glatte" bakterier med levende "ru" former.<ref>{{cite journal | author = Griffith F | title = The significance of pneumococcal types | journal = The Journal of Hygiene (London) | volume = 27 | issue = 2 | pages = 113–59 | date = January 1928 | pmid = 20474956 | pmc = 2167760 | doi = 10.1017/S0022172400031879 }}</ref><ref>{{cite journal | author = Lorenz MG, Wackernagel W | title = Bacterial gene transfer by natural genetic transformation in the environment | journal = Microbiol. Rev. | volume = 58 | issue = 3 | pages = 563–602 | year = 1994 | pmid = 7968924 | pmc = 372978 }}</ref> Dette system gav den første klare indikation af, at DNA bærer på genetisk information – [[Avery-MacLeod-McCarty-eksperimentet]] – da [[Oswald Avery]], sammen med kollegaerne [[Colin Munro MacLeod|Colin MacLeod]] og [[Maclyn McCarty]], identificerede DNA som [[Griffith's eksperiment|det transformerende princip]] i 1943.<ref>{{cite journal | author = Avery OT, Macleod CM, McCarty M | title = Studies on the Chemical Nature of the Substance Inducing Transformation of Pneumococcal Types: Induction of Transformation by a Desoxyribonucleic Acid Fraction Isolated from Pneumococcus Type Iii | journal = J Exp Med | volume = 79 | issue = 2 | pages = 137–158 | year = 1944 | pmid = 19871359 | pmc = 2135445 | doi = 10.1084/jem.79.2.137 }}</ref> DNA's rolle i [[arv]] blev bekræftet i 1952, da [[Alfred Hershey]] og [[Martha Chase]] i [[Hershey-Chase-eksperimentet]] påviste, at DNA er [[T2 fag]]ens [[genetisk materiale|genetiske materiale]].<ref>{{cite journal | author = Hershey AD, Chase M | title = Independent Functions of Viral Protein and Nucleic Acid in Growth of Bacteriophage | journal = J Gen Physiol | volume = 36 | issue = 1 | pages = 39–56 | year = 1952 | pmid = 12981234 | pmc = 2147348 | doi = 10.1085/jgp.36.1.39 }}</ref>
 
I 1953 foreslog [[James Watson]] og [[Francis Crick]] det, der nu er accepteret som den første korrekte dobbelthelix-model af DNA-strukturen, i tidsskriftet ''Nature''.<ref name=FWPUB/> Deres dobbeltheliske, molekylære DNA-model var dengang baseret på et enkelt [[krystallografi|røntgendiffraktionsbillede]] (kaldt "[[Foto 51]]")<ref>The B-DNA X-ray pattern [http://osulibrary.oregonstate.edu/specialcollections/coll/pauling/dna/pictures/sci9.001.5.html on the right of this linked image] was obtained by [[Rosalind Franklin]] and [[Raymond Gosling]] in May 1952 at high hydration levels of DNA and it has been labeled as "Photo 51"</ref> taget af [[Rosalind Franklin]] og [[Raymond Gosling]] i maj 1952, såvel som informationen om, at DNA-baserne er parrede – også opnået gennem privat kommunikation fra Erwin Chargaff i de tidligere år.
 
Eksperimentelt bevis til støtte for Watson og Cricks model blev udgivet i en serie af fem artikler i den samme udgave af ''Nature''.<ref name=NatureDNA50>Nature Archives [http://www.nature.com/nature/dna50/archive.html Double Helix of DNA: 50 Years]</ref> Ud af disse var Franklin og Goslings rapport den første udgivelse af deres egne røntgendiffraktionsdata og originale analyse, som delvist understøttede Watson og Cricks model;<ref name=NatFranGos/><ref>{{cite web|url=http://osulibrary.oregonstate.edu/specialcollections/coll/pauling/dna/pictures/franklin-typeBphoto.html |title=Original X-ray diffraction image |publisher=Osulibrary.oregonstate.edu |accessdate=6. februar 2011}}</ref> denne udgave indeholdt også en artikel om DNA-strukturen af [[Maurice Wilkins]] og to af hans kollegaer, hvis analyse og ''in vivo'' B-DNA røntgenmønstre også understøttede tilstedeværelsen ''in vivo'' af dobbelthelix-DNA-konfigurationer som foreslået af Crick og Watson.<ref name="NatWilk" /> I 1962, efter Franklin's død, blev Watson, Crick og Wilkins i fællesskab tildelt [[Nobelprisen i fysiologi eller medicin]]<ref>[http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/1962/ The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962] Nobelprize .org Accessed 22 December 06</ref> (nobelpriser tildeles kun levende personer). Der er fortsat debat omkring, hvem der bør tilskrives opdagelsen.<ref>{{cite journal | author = Maddox B | title = The double helix and the 'wronged heroine' | journal = Nature | volume = 421 | issue = 6921 | pages = 407–408 | date = 23. januar 2003 | pmid = 12540909 | doi = 10.1038/nature01399 | url = http://www.biomath.nyu.edu/index/course/hw_articles/nature4.pdf | format = PDF | bibcode = 2003Natur.421..407M }}</ref>
 
I en indflydelsesrig præsentation i 1957 forklarede Crick [[molekylærbiologiens centrale dogme]], som forudsagde forholdet mellem DNA, RNA og proteiner, og formulerede "adaptorhypotesen".<ref>Crick, F.H.C. [http://genome.wellcome.ac.uk/assets/wtx030893.pdf On degenerate templates and the adaptor hypothesis (PDF).] genome.wellcome.ac.uk (Lecture, 1955). Retrieved 22 December 2006.</ref> Den endelige bekræftelse af replikationsmekanismen, der blev antydet af dobbelthelix-strukturen, fulgte i 1958 i form af Meselson-Stahl-eksperimentet.<ref>{{cite journal | author = Meselson M, Stahl FW | title = The replication of DNA in Escherichia coli | journal = Proc Natl Acad Sci USA | volume = 44 | issue = 7 | pages = 671–82 | year = 1958 | pmid = 16590258 | pmc = 528642 | doi = 10.1073/pnas.44.7.671 | bibcode = 1958PNAS...44..671M }}</ref> Yderligere arbejde af Crick og kollegaer viste, at den genetiske kode blev baseret på ikke-overlappende basetripletter, kaldet [[codon]]er, hvilket gjorde [[Har Gobind Khorana]], [[Robert W. Holley]] og [[Marshall Warren Nirenberg]] i stand til at dechifrere den genetiske kode.<ref>[http://nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/1968/ The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1968] Nobelprize.org Accessed 22 December 06</ref> Disse fund kom til at repræsentere molekylærbiologiens fødsel.
Linje 304:
<div style="height: 400px<!--højde-->; overflow: auto; padding: 3px;text-align: left; border:solid 1px;" title="braglist:-/"; >{{reflist|3}}</div>
 
== Yderligere læsning ==
{{refbegin|30em}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=Berry, Andrew; [[James Watson|Watson, James]]. |title=DNA: the secret of life |publisher=Alfred A. Knopf |location=New York |year=2003 |isbn=0-375-41546-7 }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |title=Understanding DNA: the molecule & how it works |author=Calladine, Chris R.; Drew, Horace R.; Luisi, Ben F. and Travers, Andrew A. |year=2003 |publisher=Elsevier Academic Press |location=Amsterdam |isbn=0-12-155089-3 }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=Dennis, Carina; Julie Clayton |title=50 years of DNA |publisher=Palgrave Macmillan |location=Basingstoke |year=2003 |isbn=1-4039-1479-6 }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} [[Horace Freeland Judson|Judson, Horace F]]. 1979. ''The Eighth Day of Creation: Makers of the Revolution in Biology''. Touchstone Books, ISBN 0-671-22540-5. 2nd edition: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1996 paperback: ISBN 0-87969-478-5. {{en sprog}}
* {{en sprog}} Micklas, David. 2003. ''DNA Science: A First Course''. Cold Spring Harbor Press: ISBN 978-0-87969-636-8. {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=Olby, Robert C. |authorlink=Robert Olby |title=The path to the double helix: the discovery of DNA |publisher=Dover Publications |location=New York |year=1994 |isbn=0-486-68117-3 }}, first published in October 1974 by MacMillan, with foreword by Francis Crick;the definitive DNA textbook,revised in 1994 with a 9-page postscript. {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=Olby, Robert C. |title=Francis Crick: A Biography |publisher=Cold Spring Harbor Laboratory Press |location=Plainview, N.Y |year=2009 |isbn=0-87969-798-9 }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=Ridley, Matt |authorlink=Matt Ridley |title=Francis Crick: discoverer of the genetic code |publisher=Eminent Lives, Atlas Books |location=Ashland, OH |year=2006 |isbn=0-06-082333-X }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} Rosenfeld, Israel. 2010. ''DNA: A Graphic Guide to the Molecule that Shook the World''. Columbia University Press: ISBN 978-0-231-14271-7. {{en sprog}}
* {{en sprog}} Schultz, Mark and Zander Cannon. 2009. ''The Stuff of Life: A Graphic Guide to Genetics and DNA''. Hill and Wang: ISBN 0-8090-8947-5. {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=[[Gunther Stent|Stent, Gunther Siegmund]]; Watson, James. |title=[[The Double Helix|The double helix: a personal account of the discovery of the structure of DNA]] |publisher=Norton |location=New York |year=1980 |isbn=0-393-95075-1 }} {{en sprog}}
* {{en sprog}} Watson, James. 2004. ''DNA: The Secret of Life''. Random House: ISBN 978-0-09-945184-6 {{en sprog}}
* {{en sprog}} {{cite book |author=[[Maurice Wilkins|Wilkins, Maurice]] |title=The third man of the double helix: the autobiography of Maurice Wilkins |publisher=University Press |location=Cambridge, Eng |year=2003 |isbn=0-19-860665-6 }} {{en sprog}}
{{refend}}
 
Linje 329:
* [http://news.bbc.co.uk/1/hi/sci/tech/3703935.stm 12 May, 2004, BBC News: 'Junk' throws up precious secret] Citat: "..."It is very lucky that entire genomes were mapped, as this work is showing." He added: "I think other bits of 'junk' DNA will turn out not to be junk. I think this is the tip of the iceberg, and that there will be many more similar findings."..."
* [https://www.retsinformation.dk/Forms/R0710.aspx?id=836 Lov om oprettelse af et centralt dna-profilregister]
* [http://www.kristeligt-dagblad.dk/artikel/289689:Kultur--DNA---Det-Nedarves-Altsammen DNA = Det Nedarves Altsammen?&nbsp;| Kristeligt Dagblad]
* [http://videnskab.dk/miljo-naturvidenskab/dna-analyser-afslorer-mindst-11-ulve-i-danmark? DNA-analyser afslører: Mindst 11 ulve i Danmark. Videnskab.dk]
 
Linje 337:
 
{{autoritetsdata}}
{{god}}
 
[[Kategori:Biologi]]
Line 346 ⟶ 347:
[[Kategori:DNA| ]]
[[Kategori:Kvælstofforbindelser]]
 
{{god}}