Transskriptionsfaktor: Forskelle mellem versioner

Content deleted Content added
m typo
m bot: indsæt skabelon autoritetsdata; kosmetiske ændringer
Linje 1:
[[FileFil:Transcription Factors.svg|thumb|442px|Illustration af kompleksiteten af en aktiverende transkriptionsfaktors virkemåde]]
 
[[FileFil:1r4o.png|thumb|Molekylmodel af DNA og de DNA-bindende [[Proteindomæne|domæner]] af den dimere glucocorticoid-receptor, en [[kernereceptor]] og transskriptionsfaktor]]
 
[[ImageFil:CREB protein.png|thumb|”Leucinlynlåsen” findes som det DNA-bindende domæne i mange transkriptionsfaktorer i alle eukaryoter]]
 
[[FileFil:P53.png|thumb|Molekylmodel af transskriptionsfaktoren p53 i kompleks med DNA]]
 
 
[[FileFil:P53 Schematic.tif|thumb|right|p53 - en skitse af [[proteindomæne]]rne (NLS = Nuclear Localization Signal)|360x360px]]
'''Transskriptionsfaktorer'''<ref>ofte skrevet '''transkriptionsfaktorer'''</ref> er proteiner, der har en overordnet rolle i organismens liv ved at sikre, at de rigtige gener er udtrykt i den rigtige celle på det rigtige tidspunkt og i den rigtige mængde - igennem hele livet. I molekylærbiologiske termer er en transskriptionsfaktor et sekvens-specifikt DNA-bindende protein, der regulerer omskrivningen (transskriptionen) af den genetiske information fra DNA til messenger RNA. Reguleringen sker ved at en transskriptionsfaktor binder sig specifikt til en bestemt DNA sekvens for derved at starte processer, der tænder eller slukker for gen-ekspressionen og derved bestemmer detailniveauet af [[proteinbiosyntese]]n. De fleste af cellens [[signaltransduktion|signalveje]] har en transskriptionsfaktor som slutpunkt.
 
Det menneskelige [[genom]] koder for omkring 2600 proteiner med et DNA-bindende [[domæne]], hvoraf langt de fleste tænkes at være transskriptionsfaktorer. Det er mere end 10% af alle 20.344 af menneskets protein-kodende gener, og transskriptionsfaktorerne er dermed en af de største familier af proteiner, som kendes.
 
Man kender transskriptionsfaktorer, der virker alene, og transskriptionsfaktorer, der virker sammen med andre transskriptionsfaktorer eller andre proteiner for at fremme (som en aktivator) eller blokere (som en repressor) bindingen af [[RNA-polymerase]] til specifikke gener. Mange gener viser sig at være flankeret af flere bindingssteder for transskriptionsfaktorer (responselementer), hvor en effektiv transskription kræver samvirke af flere transskriptionsfaktorer.
 
== DNA-binding ==
 
Et afgørende element for transskriptionsfaktorerne er, at de indeholder mindst et DNA-bindende [[proteindomæne]] (DBD), der knyttes til en bestemt sekvens af DNA (et responselement, en promotor eller en enhancer), som støder op til det gen eller de gener, der skal reguleres. Transskriptionsfaktorerne er inddelt i klasser baseret på arten af deres DNA-bindende domæne. Andre proteiner er også betydningsfulde for reguleringen af transskriptionen, men adskiller sig fra transskriptionsfaktorerne ved ikke at indeholde DNA-bindende domæner; det er bl.a. coaktivatorer, histon-acetyltransferaser, histon-deacetylaser, kinaser (se billedet ovenfor).
 
== Mekanisme ==
 
Transskriptionsfaktorerne er en meget blandet familie af proteiner, der oftest fungerer i samspil med andre proteiner, der er med til at bestemme specificiteten af processerne. Transkriptionsfaktorerne bruger en bred vifte af mekanismer til regulering af genekspressionen:
Linje 25:
* stabilisering eller blokering af bindingen af [[RNA-polymerase]] til DNA
 
* katalysering af acetylering eller deacetylering af [[histon]]er enten direkte eller ved rekruttering af andre proteiner med denne katalytiske aktivitet.
 
* rekruttering af coactivatorer eller corepressor-proteiner til transskriptionfaktor-DNA-komplekset (se billedet).
 
== Mutationer ==
 
En mutation i en transskriptionsfaktor kan forårsage store ændringer i reguleringen af transskriptionen/genekspressionen/[[proteinsyntesen]] og kan derved forårsage specifikke sygdomme. Gener for transskriptionsfaktorerne benævnes som [[oncogen]]er fordi mutationer kan føre til [[kræft]]. De benævnes også som suppressor-gener, da den normale funktion netop ikke fører til [[kræft]]dannelse.
 
== Nogle eksempler ==
 
* p53 (eng. tumor protein p53, cellular tumor antigen p53, phosphoprotein p53, tumor suppressor p53, antigen NY-CO-13, transformation-related protein 53 eller TRP53) er en overordnet transskriptionsfaktor, der er centrum i et komplekst system af [[signaltransduktion|signalveje]].<ref>[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2908772/#!po=6.73077 Transcriptional Regulation by P53. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 2010]</ref> I mange kræftceller findes p53 med en eller flere mutationer, der har medført ændringer i p53’s normale funktion.
Linje 41:
* CREB (eng. cAMP response element-binding protein) har bl.a. betydning for langtids[[hukommelse]], neuroplasticitet og [[Alzheimers sygdom]].
 
* NF-κB (eng. nuclear factor 'kappa-light-chain-enhancer' of activated B-cells) har stor betydning for reguleringen af [[immunsystem|immunresponsimmunresponset]]et, for celleproliferation og [[apoptose]] (celledød).
 
* NF-AT (eng. nuclear factor of activated T-cells) er en familie af transskriptionsfaktorer, der regulerer genekspressionen af [[cytokin]]er som f.eks. interleukin-2 (IL-2).
Linje 58:
 
{{reflist}}
{{autoritetsdata}}
 
 
[[Kategori:Biokemi]]