CEPOS modtager ikke midler fra hverken andre politiske organisationer eller politiske partier, men har en stor række af private donorer. Alle deres sponsorer er, som det normalt ses, ikke offentligt kendte, og deri lighed med andre foreninger og private fonde er der ikke publiceret offentlige årsregnskaber. Nogle donorer ønsker dog selv at stå frem. CEPOS Universitet, der underviser studerende i frimarkedstænkning, erhar tidligere været sponsoreret af [[Saxo Bank]] med 6-700.000 kr.<ref>''Et par borgerlige ord'', Weekendavisen nr. 33, 18. - 24. august 2006</ref>
