Som nævnt opførtes efter reformationen en herregård, Sortebrødregaard. Denne gård er udviddetudvidet afad flere omgange. Byggematerialet er røde [[munkesten]]. Hovedfløjen med kvisten mod gårdsiden synes ældst, mens sidefløjene vistnok er senere tilføjelser. Alt i to [[stokværk]] over en kælder. Anlægget blev istandsat af [[Peder Reedtz]] omkring 1670. Bygningen blev udviddetudvidet [[1907]] med endnu en fløj ved arkitekt [[Jens Ingwersen]]. Bygningen rummer en meget smuk [[riddersal]] med [[gyldenlædertapet]]er samt et unikt [[kassetteloft]] med 60 bibelske malerier. I sidefløjen findes klosterkirken, der anvendes til almindelige, offentlige gudstjenester, hver den første søndag i måneden (bortset fra januar og juli). Den har en udskåret [[barok]]-[[altertavle]] med våbenskjolde[[Våben (heraldik)|våbener]] for [[Niels Juel]] og [[Margrethe Ulfeldt]]. Desuden et [[krucifiks]] i [[elfenben]] udskåret 1546 af [[kansler]] [[Johan Friis]]. Det meget specielle [[Matthison-Hansen]]-orgel, som tilhører [[Roskilde Museum]], er opstillet i klosterkirken efter en omfattende [[restaurering]] i [[1993]].
