Kommissionens lovgivningsinitiativ har normalt været centreret på økonomisk regulering. Den har fremsat et stort antal reguleringer baseret på et "[[forsigtighedsprincippet|forsigtighedsprincip]]". Dette betyder at der kan foretages foregribende reguleringer, hvis der findes en troværdig fare for miljøet eller menneskers sundhed: for eksempel ved at tackle [[klimaforandringer]] og begrænse [[GMO|genetisk modificerede organismer]], uden at vægte disse reguleringer efter deres påvirkning af økonomien. Kommissionen foreslår derfor ofte mere striks lovgivning end andre lande. På grund af det europæiske markeds størrelse har dette gjort EU-lovgivning til en vigtig påvirkning af det globale marked.<ref>{{cite news|work=The Economist|date=20. september 2007|title=Brussels rules OK|url=http://www.economist.com/world/europe/displaystory.cfm?story_id=9832900|accessdate=22. oktober 2007}}</ref>
Senest har Kommissionen bevæget sig mod oprettelsen af af [[Det europæiske område for frihed, sikkerhed og retfærdighed|europæisk strafferet]]. I 2006 førte dumpning af giftigt affald ud for Elfenbenskysten Kommissionen til at fokusere på lovgivning mod giftigt affald. Nogle EU-stater havde på det tidspunkt slet ikke nogen lov mod transport af giftigt affald, hvilket fik kommissionsmedlemmerne [[Franco Frattini]] og [[Stavros Dimas]] til at fremsætte idéen om "økologisk kriminalitet". Kommissionens ret til at fremsætte strafferetlige lovgivning er blevet udfordret i [[Domstolen (øverste instans)|EU-Domstolen]], hvor den blev stadfæstet. Pr. 2007 var det eneste andet strafferetlige lovforslag fra Kommissionen [[Ændret forslag til Europa-Parlamentets og Rådets direktiv om strafferetlige foranstaltninger til håndhævelse af intellektuelle ejendomsrettigheder|et direktiv om intellektuelle ejendomsrettigheder]],<ref name="E!Sharp0507 Legal">{{cite news|last=Charter|first=David|title=A new legal environment|work=E!Sharp|pages=23–5|publisher=People Power Process|year=2007}}</ref> samt en ændring til en rammeafgørelse om antiterrorisme fra 2002, der forbyder terrorisme-relateret tilskyndelse, rekruttering (særligt over Internettet) og træning.<ref>{{cite web|publisher=European Commission|date=6. november 2007|title=Counter‑terrorism – EU steps up a gear|url=http://ec.europa.eu/news/justice/071106_1_en.htm|accessdate=21. november 2007|archiveurl=https://web.archive.org/web/20071213232626/http://ec.europa.eu/news/justice/071106_1_en.htm|archivedate =13. december 2007}}</ref>
