I [[19411942]] begyndte den tyske værnemagt at vise interesse for flere bygninger på området. I første omgang lykkedes det bestyrelsen at få afværget en overtagelse under henvisning til stedets lægelige funktion. I [[1942]] var slaget tabt, og der blev lavet en aftale om at værnemagten "lejede" Silkeborg Bad fra foråret [[1943]]. Det tyske hovedkvarter blev flyttet fra [[Nyboder Skole]] til Silkeborg den [[5. november]] 1943. Allerede samme dag var det nye hovedkvarter for [[Hermann von Hanneken]] fuldt funktionsklart. I [[januar]] [[1945]] afløstes von Hanneken af [[generaloberst]] [[Georg Lindemann]] som fungerede som chef for værnemagten i [[Danmark]] indtil krigsafslutningen.
