Virksomheden blev grundlagt i [[1924]] af de totre [[apoteker]]e [[Hans Trojel (apoteker)|Hans Trojel]], [[Mathias Maagaard]] og [[V.H. Meyer]], og navnet stammer fra deres navne: Trojel Og Meyer (s'et blev tilføjet af hensyn til placeringen i slikautomater, hvor man ikke var glade for at have 'Tom' stående). I årene efter [[2. verdenskrig]] voksede Toms under ledelse af [[Victor B. Strand]] sig stor med overtagelse af [[Anthon Berg]], [[Pingvin Lakrids]] I [[1971]] blev [[Galle & Jessen]] pålægschokolade en del af Toms og fungerer stadig som egne brands. Dengang flyttede de af praktiske årsager produktionen af pålægschokolade til Toms. I dag er Toms logoet også kommet uden på pakkerne. Inden for de senere år har man opkøbt blandt andet [[Bonbon]] og nogle udenlandske virksomheder inden for samme branche.
Omkring 2000 var Toms Fabrikker involveret i en sag om [[muslimsk tørklæde|muslimske tørklæder]] på arbejdspladsen:
